More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3020 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3020  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
360 aa  681    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  56.4 
 
 
365 aa  286  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  49.44 
 
 
386 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2176  glycosyl transferase group 1  51.99 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000383211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  47.18 
 
 
388 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6051  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.83 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2006  group 1 glycosyl transferase  45.66 
 
 
411 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.669637  normal  0.233825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3003  glycosyl transferase group 1  46.41 
 
 
375 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  41.19 
 
 
357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  44.84 
 
 
964 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2350  glycosyl transferase group 1  43.8 
 
 
359 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169241  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5412  glycosyl transferase group 1  40.12 
 
 
366 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3142  glycosyl transferase group 1  45.65 
 
 
363 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  0.711865 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
378 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
412 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
376 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.53 
 
 
369 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13720  glycosyltransferase  42.15 
 
 
351 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
365 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
398 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
377 aa  106  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
364 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
373 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
398 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
384 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
374 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 
396 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
356 aa  100  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 
1079 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
372 aa  99.4  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
377 aa  99.4  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
371 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  31.85 
 
 
342 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
396 aa  97.4  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
398 aa  96.3  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
377 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  40.57 
 
 
384 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  42.45 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
379 aa  92.8  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
412 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
385 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
394 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.34 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  24.34 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  24.34 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
371 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.34 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  24.34 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
362 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
385 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.34 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 
375 aa  89.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.61 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.61 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
361 aa  89.4  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
364 aa  89.4  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
382 aa  89.4  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 
381 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
369 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  24.57 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  31.09 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
413 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
388 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
391 aa  87  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.63 
 
 
366 aa  86.7  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
381 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  24.91 
 
 
343 aa  87  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
369 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
369 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 
381 aa  86.3  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
394 aa  86.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
369 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
364 aa  86.3  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.54 
 
 
745 aa  86.3  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
417 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.07 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  31.75 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  36.88 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  38.39 
 
 
739 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>