More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1142 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1142  putative cytochrome P450  100 
 
 
421 aa  833    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15529  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2803  putative cytochrome P450-family protein  53.27 
 
 
414 aa  421  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348302  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4812  cytochrome P450-family protein  51.98 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2751  putative cytochrome P450-family protein  52.27 
 
 
426 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.581871  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5490  putative cytochrome P450  50.94 
 
 
437 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0347822  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5491  putative cytochrome P450  53.02 
 
 
488 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767325  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4334  putative cytochrome P450  39.91 
 
 
484 aa  296  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33530  cytochrome P450  38.82 
 
 
410 aa  253  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101916  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4583  putative cytochrome P450  39.23 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2975  putative cytochrome P450  39.69 
 
 
452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1747  putative cytochrome P450  35.84 
 
 
454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0264528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4184  cytochrome P450 monooxygenase  35.75 
 
 
406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1685  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1433  Cytochrome P450-like protein  35.04 
 
 
424 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.667112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4420  putative cytochrome P450  36.53 
 
 
440 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2597  Cytochrome P450  35.34 
 
 
500 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4556  putative cytochrome P450  32.41 
 
 
442 aa  176  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3959  Cytochrome P450-like protein  35.21 
 
 
465 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  31.31 
 
 
426 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  29.4 
 
 
409 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  28.36 
 
 
405 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  29.58 
 
 
409 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  28.29 
 
 
412 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  31.2 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  28.33 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  28.89 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  29.31 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  24.88 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  25.87 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  24.63 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  28.67 
 
 
411 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  31.99 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  25.78 
 
 
411 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  32.92 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  23.23 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  28.3 
 
 
423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  26.77 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  29.49 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  26.63 
 
 
411 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  30.38 
 
 
412 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  26.17 
 
 
411 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  26.17 
 
 
411 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  25.89 
 
 
411 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  25.86 
 
 
411 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  30.33 
 
 
408 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  27.98 
 
 
420 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  25.55 
 
 
411 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  26.71 
 
 
411 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  28.61 
 
 
409 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  25.55 
 
 
411 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  26.41 
 
 
424 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  26.68 
 
 
422 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  27.75 
 
 
436 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.22 
 
 
398 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  28.68 
 
 
424 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  26.42 
 
 
419 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  26.33 
 
 
408 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  30.56 
 
 
402 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  28.72 
 
 
436 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  22.98 
 
 
410 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  29.17 
 
 
408 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  27.95 
 
 
405 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  31.66 
 
 
406 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  27.9 
 
 
400 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  32.14 
 
 
402 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  25.99 
 
 
387 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  27.25 
 
 
421 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  30.22 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  31.15 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  31.15 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  27.86 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  32.06 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  28.02 
 
 
398 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  31.17 
 
 
407 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  29.71 
 
 
396 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  28.31 
 
 
410 aa  97.1  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  25.92 
 
 
414 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  27.51 
 
 
391 aa  96.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  28.53 
 
 
399 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  29.81 
 
 
357 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  28.17 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  26.18 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  27.84 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  26.84 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  29.06 
 
 
417 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  27.76 
 
 
421 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  27.96 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  28.39 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  27.1 
 
 
400 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  28.1 
 
 
405 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  29.38 
 
 
410 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  28.88 
 
 
405 aa  94  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  27.74 
 
 
423 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  27.74 
 
 
423 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  28.22 
 
 
418 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  26.09 
 
 
414 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  28.22 
 
 
418 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  28.22 
 
 
418 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  25.85 
 
 
400 aa  92.8  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  25.73 
 
 
399 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  28.05 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>