112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0456 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 251 aa  500  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  78.01 
 
 		 244 aa  335  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  70.09 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  67.87 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  54.51 
 
 		 241 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  50.21 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  50.9 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  51.08 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  47.37 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  39.01 
 
 		 172 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  39.71 
 
 		 155 aa  98.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  38.97 
 
 		 169 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  40.96 
 
 		 193 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  34.93 
 
 		 169 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  32.85 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  27.34 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  36.29 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  36.29 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  36.29 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  31.78 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  33.58 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  35.2 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  31.34 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  34.4 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  46.03 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0959  hypothetical protein  48.48 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.498536 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  46.03 
 
 		 380 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  48.53 
 
 		 370 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  46.15 
 
 		 466 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  31.01 
 
 		 152 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  50 
 
 		 385 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  50 
 
 		 385 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  49.18 
 
 		 386 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  49.18 
 
 		 386 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  26.83 
 
 		 152 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  50 
 
 		 385 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  42.62 
 
 		 386 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  27.94 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  27.21 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  41.38 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  32.5 
 
 		 179 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  25.48 
 
 		 160 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  35.24 
 
 		 322 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  35.24 
 
 		 322 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  35.24 
 
 		 322 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  35.24 
 
 		 322 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  35.24 
 
 		 322 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  35.24 
 
 		 322 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  45.9 
 
 		 386 aa  45.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  31.03 
 
 		 159 aa  45.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  40.91 
 
 		 385 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  40.91 
 
 		 385 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 386 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  27.05 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  37.1 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  37.1 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  37.1 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  37.1 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  37.1 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  37.1 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  37.1 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  37.1 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  37.1 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  39.66 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  43.55 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  34.29 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  34.29 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  34.29 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  34.29 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  34.29 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  34.29 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05593  IS1112 transposase  34.29 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  44.26 
 
 		 386 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  32.61 
 
 		 153 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  39.68 
 
 		 197 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  28.66 
 
 		 400 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>