35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2755 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 1147 aa  2231    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  33.76 
 
 		 1051 aa  337  9e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  34.93 
 
 		 1066 aa  310  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  30.13 
 
 		 1086 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  31.72 
 
 		 1079 aa  293  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1002 aa  119  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1090 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  29.51 
 
 		 969 aa  97.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  30.73 
 
 		 1385 aa  88.6  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  29.57 
 
 		 935 aa  84.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  36.52 
 
 		 628 aa  83.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4039  transcriptional regulator, SARP family  32.02 
 
 		 1041 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.039203  normal  0.0409603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6300  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1655 aa  78.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0694  hypothetical protein  31.5 
 
 		 564 aa  78.2  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  27 
 
 		 1091 aa  74.3  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.88 
 
 		 992 aa  72.8  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.33 
 
 		 988 aa  68.2  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  26.92 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  29.44 
 
 		 994 aa  61.6  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 304 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  33.91 
 
 		 429 aa  56.2  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  36.75 
 
 		 307 aa  55.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  33.86 
 
 		 466 aa  54.3  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.67 
 
 		 568 aa  54.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  33.91 
 
 		 448 aa  54.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  32.33 
 
 		 546 aa  53.5  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.57 
 
 		 1124 aa  53.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  33.58 
 
 		 341 aa  52.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1135  phage lysin-like lysozyme M1  37.21 
 
 		 411 aa  52  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 		 242 aa  52  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1312  peptidoglycan-binding LysM  27.21 
 
 		 235 aa  48.5  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.64 
 
 		 295 aa  47.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.9 
 
 		 470 aa  47.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  40.86 
 
 		 380 aa  46.2  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4449  peptidoglycan-binding LysM  37.89 
 
 		 407 aa  45.8  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>