155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1589 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1589  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 626 aa  1231    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0430994  normal  0.447949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2165  hypothetical protein  46.45 
 
 		 490 aa  346  6e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199835  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1742  cyclic nucleotide-binding protein  34.87 
 
 		 626 aa  296  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.550637  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2465  cyclic nucleotide-binding protein  32.84 
 
 		 607 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2510  cyclic nucleotide-binding protein  32.84 
 
 		 607 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2502  cyclic nucleotide-binding protein  32.67 
 
 		 607 aa  254  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3086  cyclic nucleotide-binding protein  34 
 
 		 615 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.238532 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  29.96 
 
 		 615 aa  142  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  26.28 
 
 		 601 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  25.48 
 
 		 643 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 		 623 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  25.04 
 
 		 646 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.84 
 
 		 613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 		 624 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.77 
 
 		 606 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  24.8 
 
 		 642 aa  126  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.64 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  24.36 
 
 		 645 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  25.32 
 
 		 645 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  24.12 
 
 		 645 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  23.96 
 
 		 645 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  23.83 
 
 		 645 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.02 
 
 		 605 aa  117  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  23.65 
 
 		 645 aa  115  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  24.77 
 
 		 623 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.89 
 
 		 648 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  23.34 
 
 		 639 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  25.77 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  26.18 
 
 		 629 aa  110  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.76 
 
 		 644 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  22.59 
 
 		 633 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  21.07 
 
 		 618 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.48 
 
 		 649 aa  108  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  24.23 
 
 		 615 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  23.5 
 
 		 624 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  24.76 
 
 		 646 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.38 
 
 		 596 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  27.06 
 
 		 606 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  23.66 
 
 		 644 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  26.28 
 
 		 618 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  26.84 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  24.72 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  23.26 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  27.12 
 
 		 574 aa  105  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  21.62 
 
 		 638 aa  105  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  23.63 
 
 		 622 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  22.9 
 
 		 629 aa  104  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.09 
 
 		 660 aa  104  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  28.45 
 
 		 603 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  21.52 
 
 		 650 aa  103  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.88 
 
 		 635 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  26.2 
 
 		 481 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  24.78 
 
 		 615 aa  100  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.93 
 
 		 605 aa  99.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  23.1 
 
 		 641 aa  100  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.93 
 
 		 601 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.61 
 
 		 601 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  24.88 
 
 		 663 aa  98.2  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  23.35 
 
 		 648 aa  97.8  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.83 
 
 		 633 aa  97.4  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  22.2 
 
 		 615 aa  97.4  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  25.54 
 
 		 606 aa  97.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  24.42 
 
 		 637 aa  96.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  22.68 
 
 		 615 aa  95.1  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  20.8 
 
 		 627 aa  95.1  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  23.51 
 
 		 629 aa  94.7  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  21.78 
 
 		 625 aa  92.8  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  21.67 
 
 		 622 aa  92  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.68 
 
 		 625 aa  91.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  25.73 
 
 		 601 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  21.34 
 
 		 626 aa  90.9  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  21.44 
 
 		 625 aa  90.5  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.83 
 
 		 603 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  21.92 
 
 		 615 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  21.92 
 
 		 615 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  23.89 
 
 		 637 aa  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  21.92 
 
 		 615 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  24.21 
 
 		 565 aa  90.1  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  23.2 
 
 		 629 aa  90.1  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  22.44 
 
 		 607 aa  89.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  22.44 
 
 		 615 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.83 
 
 		 603 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  21.62 
 
 		 641 aa  88.6  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  21.74 
 
 		 615 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  22.24 
 
 		 629 aa  88.2  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3142  CBS domain-containing protein  24.75 
 
 		 608 aa  87.4  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1634  hypothetical protein  27.19 
 
 		 351 aa  87  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  22.47 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  21.26 
 
 		 620 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  25.35 
 
 		 646 aa  86.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2049  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  28.61 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82123  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.33 
 
 		 603 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  21.08 
 
 		 620 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  21.44 
 
 		 626 aa  82.4  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.63 
 
 		 667 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  21.26 
 
 		 620 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  21.26 
 
 		 620 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  20.21 
 
 		 601 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  21.89 
 
 		 615 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  19.83 
 
 		 600 aa  81.3  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>