38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1022 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  100 
 
 		 804 aa  1537    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  44.54 
 
 		 738 aa  532  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  30.31 
 
 		 845 aa  231  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  29.94 
 
 		 980 aa  137  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  30.85 
 
 		 1057 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1024  Cna B domain protein  30.27 
 
 		 2332 aa  66.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  30.69 
 
 		 1053 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  30.37 
 
 		 1202 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  32.26 
 
 		 1073 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  25.79 
 
 		 1167 aa  60.8  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  27.76 
 
 		 812 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  31.22 
 
 		 1034 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26640  putative collagen-binding protein  28.77 
 
 		 2148 aa  59.3  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  31.34 
 
 		 1518 aa  57.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  33.33 
 
 		 690 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  24.88 
 
 		 1157 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4381  Ricin B lectin  24.74 
 
 		 476 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.59 
 
 		 753 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5377  hypothetical protein  27.08 
 
 		 446 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  24.74 
 
 		 894 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2929  hypothetical protein  27.23 
 
 		 447 aa  52  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  25.27 
 
 		 681 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4382  Ricin B lectin  24.23 
 
 		 490 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.488443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  26.74 
 
 		 680 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  38.3 
 
 		 918 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3511  hypothetical protein  29.57 
 
 		 926 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.45252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  25.61 
 
 		 2474 aa  48.9  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  24.4 
 
 		 1428 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  24.31 
 
 		 1424 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.38 
 
 		 966 aa  47.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0398  hypothetical protein  27.23 
 
 		 773 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  28.52 
 
 		 3373 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3169  S-layer domain-containing protein  29.33 
 
 		 533 aa  46.2  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2254  hypothetical protein  25.65 
 
 		 443 aa  45.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136366  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3801  fibronectin type III domain-containing protein  22.67 
 
 		 484 aa  45.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00993794  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.56 
 
 		 577 aa  45.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3311  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.11 
 
 		 742 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2252  hypothetical protein  29.23 
 
 		 640 aa  44.3  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.991469  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>