More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0813 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 516 aa  1029    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  59.39 
 
 		 517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  56.19 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  51.08 
 
 		 507 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  47.46 
 
 		 553 aa  473  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  51.04 
 
 		 517 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  50.3 
 
 		 535 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  50.7 
 
 		 513 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  50.1 
 
 		 535 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  52.28 
 
 		 524 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  49.9 
 
 		 512 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  49.3 
 
 		 511 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  47 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  44.7 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  44.88 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  45.4 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 		 476 aa  361  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  42.02 
 
 		 503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  38.9 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  36.31 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  36.14 
 
 		 484 aa  272  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  30.45 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 		 456 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  31.08 
 
 		 456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 485 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  26.92 
 
 		 458 aa  156  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 455 aa  136  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 		 450 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  24.67 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  24.48 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  22.04 
 
 		 461 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  22.04 
 
 		 461 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  22.04 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  22.04 
 
 		 461 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 443 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  22.04 
 
 		 461 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  23.68 
 
 		 450 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  22.04 
 
 		 461 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  22.04 
 
 		 461 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  22.04 
 
 		 461 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  21.94 
 
 		 456 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 462 aa  90.1  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.39 
 
 		 456 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 443 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  23.73 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  22.09 
 
 		 461 aa  89.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  23.54 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 443 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 443 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 446 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 446 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 446 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 		 454 aa  86.7  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  23.05 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  25.08 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  24.87 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  25.08 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  25.08 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  25.08 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  25.08 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  21.76 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.46 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  22.71 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  27.02 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 477 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.77 
 
 		 449 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  22.82 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  24.21 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  24.12 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  23.19 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 		 466 aa  76.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 440 aa  76.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  25.07 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>