More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0605 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0605  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 
242 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1056  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  69.16 
 
 
264 aa  296  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2611  oxidoreductase FAD-binding subunit  56.57 
 
 
198 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0922  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.4 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.44 
 
 
248 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.25 
 
 
255 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4092  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.35 
 
 
269 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  45.38 
 
 
250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.02 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  40.17 
 
 
243 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2269  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.35 
 
 
252 aa  148  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0121  oxidoreductase FAD-binding region  38.4 
 
 
248 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3261  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.15 
 
 
244 aa  141  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2080  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.17 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.7178  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5181  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.37 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2125  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.85 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.122233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2402  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.85 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0109  oxidoreductase FAD-binding region  41.63 
 
 
216 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4471  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.98 
 
 
233 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3398  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.79 
 
 
259 aa  99  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.81 
 
 
681 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0231  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  49.22 
 
 
168 aa  95.5  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.202422  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.5 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  32.24 
 
 
678 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.7 
 
 
676 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.06 
 
 
678 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  29.05 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.91 
 
 
678 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.71 
 
 
848 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  34.67 
 
 
881 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.67 
 
 
881 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1001  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  28.26 
 
 
339 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2583  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  28.26 
 
 
339 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.57 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0325  flavohemoprotein, putative  29.21 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0185  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  29.17 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0213  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  29.17 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.96 
 
 
669 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  32.16 
 
 
676 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0471  benzoate 1,2-dioxygenase, ferredoxin reductase component  38.33 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.16 
 
 
686 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2727  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  29.17 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  30.7 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.94 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.56 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1358  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  29.17 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1554  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  29.17 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.14 
 
 
687 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  27.43 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.39 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  30.74 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  31.25 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  32.51 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.02 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  28.57 
 
 
605 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.22 
 
 
699 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  32.04 
 
 
379 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  25.59 
 
 
585 aa  72  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  34 
 
 
881 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  27.27 
 
 
361 aa  72  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.11 
 
 
336 aa  72  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6093  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.28 
 
 
929 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372916  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  26.73 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.93 
 
 
684 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.88 
 
 
675 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  25 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  25.81 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.19 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.43 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  29.33 
 
 
616 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  26.98 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  28.91 
 
 
605 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6133  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.19 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  29.95 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  26.15 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  26.15 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  26.15 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1068  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.17 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.570837  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  26.15 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0230  globin  27.78 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  32.19 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.5 
 
 
585 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  37.19 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2459  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.23 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109529  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.45 
 
 
684 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.19 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.58 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0224  globin  27.78 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  30.1 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.43 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  24.79 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.1 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  25.94 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.82 
 
 
690 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.71 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1430  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.16 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0543245  normal  0.324451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  34.85 
 
 
625 aa  69.7  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  25.11 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1366  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.16 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0161467  normal  0.193638 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  25.7 
 
 
402 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>