More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_02131 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1507  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  82.78 
 
 
395 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02131  poly A polymerase family protein  100 
 
 
395 aa  789    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01561  poly A polymerase family protein  48.86 
 
 
397 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26611  Poly A polymerase family protein  45.41 
 
 
412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2392  poly A polymerase family protein  41.21 
 
 
397 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301  poly A polymerase family protein  42.89 
 
 
398 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0143  poly A polymerase family protein  36.59 
 
 
406 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01601  poly A polymerase family protein  37.53 
 
 
405 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100479  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01581  poly A polymerase family protein  37.25 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.178246  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01691  poly A polymerase family protein  35.59 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0271  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.45 
 
 
424 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0184  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.1 
 
 
408 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0791  polyA polymerase  31.63 
 
 
412 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.11993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1970  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.68 
 
 
420 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1997  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.68 
 
 
420 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.600969  normal  0.0824458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2997  polynucleotide adenylyltransferase region  29.65 
 
 
423 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1064  polynucleotide adenylyltransferase region  29.86 
 
 
423 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3833  polynucleotide adenylyltransferase region  28.44 
 
 
422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0264  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
517 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14390  poly(A) polymerase/tRNA nucleotidyl transferase  37.97 
 
 
478 aa  116  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0065  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 
467 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000449224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2184  polyA polymerase family protein  36 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  40 
 
 
450 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0314  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.84 
 
 
498 aa  110  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000179563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2285  polynucleotide adenylyltransferase region  33.68 
 
 
431 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0369543  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1521  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.08 
 
 
469 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0158  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
472 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1238  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34 
 
 
500 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1045  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.71 
 
 
474 aa  101  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0334  polyA polymerase family protein  33.16 
 
 
493 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000707313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1645  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  25.81 
 
 
438 aa  99.8  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115731  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_276  polymerase  32.65 
 
 
501 aa  99.8  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000457601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 
486 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
491 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  31.66 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  28.63 
 
 
418 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  31.96 
 
 
483 aa  86.7  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.16 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 
863 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.22 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  34.54 
 
 
863 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0612  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 
433 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26890  tRNA adenylyltransferase  23.94 
 
 
484 aa  84  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
483 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3067  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  hitchhiker  0.000000430788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 
475 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.42 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  34.41 
 
 
485 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  31 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  32.98 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.31 
 
 
398 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  27.94 
 
 
859 aa  81.3  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.38 
 
 
873 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
502 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  25.2 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2083  tRNA nucleotidyltransferase, putative  32.84 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.954334  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.74 
 
 
847 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
525 aa  79.7  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 
485 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
489 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  31.09 
 
 
475 aa  79.3  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  31.94 
 
 
523 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
496 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 
450 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.88 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  29.77 
 
 
877 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 
584 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 
552 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  27.3 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  30.58 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 
495 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25491  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.07 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  31.09 
 
 
479 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  30.62 
 
 
890 aa  77  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  25.53 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  30.05 
 
 
476 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  30.85 
 
 
480 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  27.51 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.8 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 
473 aa  76.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 
473 aa  76.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  39.5 
 
 
845 aa  76.3  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 
499 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  27.75 
 
 
883 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  30.05 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  32.24 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  28.5 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.42 
 
 
484 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.91 
 
 
821 aa  76.3  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1889  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  29.77 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5397  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 
455 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.86 
 
 
877 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 
448 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>