109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4018 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  100 
 
 
292 aa  599  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  89.35 
 
 
289 aa  535  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3607  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  73.68 
 
 
292 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2744  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  60.28 
 
 
303 aa  355  6.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4057  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  55.21 
 
 
304 aa  315  7e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  55.39 
 
 
300 aa  301  7.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  52.6 
 
 
297 aa  298  7e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.96 
 
 
286 aa  295  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5565  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  53.66 
 
 
282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8492  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.84 
 
 
273 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4540  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  52.03 
 
 
311 aa  278  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  53.41 
 
 
270 aa  277  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0727  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  48.82 
 
 
302 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  48.19 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1801  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  47.26 
 
 
314 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.359842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1724  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  47.89 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5450  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  45.92 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383375  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6847  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  46.05 
 
 
292 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1525  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  39.46 
 
 
278 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5746  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  40 
 
 
276 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.64 
 
 
287 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3840  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.37 
 
 
269 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0672  iolB protein  38.19 
 
 
269 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1279  myo-inositol catabolism IolB domain protein  40 
 
 
270 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286667  normal  0.249496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1598  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.22 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0080  hypothetical protein  39.37 
 
 
272 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0455  myo-inositol catabolism IolB region  37.36 
 
 
271 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0068  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.61 
 
 
275 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00478014  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1587  myo-inositol catabolism protein  37.74 
 
 
276 aa  143  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000101731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3317  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.8 
 
 
265 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  37.65 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1717  myo-inositol catabolism IolB region  38.13 
 
 
265 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  37.35 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.35 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0984  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.91 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.860916 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.35 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2994  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.98 
 
 
276 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1300  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.35 
 
 
272 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.35 
 
 
272 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1237  putative myo-inositol catabolism protein  37.65 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1343  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.91 
 
 
278 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4662  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.98 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.96 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1895  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.58 
 
 
272 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.211847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0979  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.18 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7801  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.01 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1700  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.46 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1132  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.78 
 
 
265 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2313  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.95 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3559  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.19 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3286  hypothetical protein  38.82 
 
 
268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1672  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.65 
 
 
268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  38.04 
 
 
267 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.22 
 
 
268 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.87 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4702  protein IolB  36.61 
 
 
269 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000356278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1576  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.42 
 
 
270 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3332  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.19 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2967  putative myo-inositol catabolism protein IolB  33.97 
 
 
271 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1868  hypothetical protein  33.97 
 
 
271 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0212123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3039  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  33.97 
 
 
271 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  36.08 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  37.01 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  36.08 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  36.08 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  36.08 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  36.08 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  35.69 
 
 
267 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  35.69 
 
 
267 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1429  myo-inositol catabolism IolB protein  38.1 
 
 
272 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191382  normal  0.741478 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2812  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.61 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0555843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3272  myo-inositol catabolism IolB  35.23 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258514  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50060  Myo-inositol catabolism protein IolB  36.97 
 
 
275 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3498  iolB protein  35.98 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  33.33 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0278  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  31.97 
 
 
265 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0499  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  30.6 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777843  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  29.67 
 
 
280 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1418  myo-inositol catabolism IolB protein  29.67 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0783277  normal  0.109536 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3350  myo-inositol catabolism IolB protein  26.19 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497522  normal  0.203778 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4744  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.33 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00116126 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1267  hypothetical protein  24.81 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647401  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0083  putative myo-inositol catabolism protein IolB  21.4 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3894  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  28.98 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.787438  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1757  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.64 
 
 
283 aa  49.7  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2991  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  23.64 
 
 
278 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.050045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02691  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  23.64 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3165  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  23.64 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02654  hypothetical protein  23.64 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3017  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24.24 
 
 
274 aa  48.9  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0847  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  23.64 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3296  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  23.64 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.578239  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2990  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  23.64 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0872  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  23.64 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4112  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  23.64 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000651475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6827  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  25.35 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2407  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  29.77 
 
 
274 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4017  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  22.27 
 
 
262 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0372282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>