67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2407 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2407  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  100 
 
 		 274 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0482  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  91.61 
 
 		 274 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2134  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  91.61 
 
 		 274 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3894  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  67.52 
 
 		 273 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.787438  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4744  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  59.86 
 
 		 281 aa  340  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4264  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  50.9 
 
 		 279 aa  302  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.968678  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6603  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  50.54 
 
 		 278 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5662  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  51.26 
 
 		 278 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0119  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomer ase  48.19 
 
 		 278 aa  298  9e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1710  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  52.9 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2944  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  48.92 
 
 		 280 aa  290  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.842443 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2738  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  49.28 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6827  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  48.36 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2384  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.38 
 
 		 276 aa  280  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1804  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.76 
 
 		 278 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0956788  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1694  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.76 
 
 		 278 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.730903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2642  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.4 
 
 		 278 aa  275  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.198375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0197  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  48.03 
 
 		 279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3296  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  47.84 
 
 		 278 aa  271  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.578239  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1910  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.4 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000905199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0395  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  45.05 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2203  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.4 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3169  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.4 
 
 		 278 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3403  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  44.6 
 
 		 286 aa  269  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0682424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0643  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  49.26 
 
 		 272 aa  268  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0399  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  45.05 
 
 		 276 aa  268  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2206  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  45.68 
 
 		 278 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3165  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  47.12 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02654  hypothetical protein  47.12 
 
 		 278 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3350  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.04 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.40902 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0847  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  47.12 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3186  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.04 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3249  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.04 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238972 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0872  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  47.12 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02691  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  47.12 
 
 		 278 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2990  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  47.12 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0395  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  44.69 
 
 		 276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3234  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.04 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2991  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.76 
 
 		 278 aa  265  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.050045 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0343  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  45.65 
 
 		 276 aa  265  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4112  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.4 
 
 		 278 aa  265  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000651475 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0670  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol- isomerase  45.29 
 
 		 276 aa  265  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208996  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5760  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  45.68 
 
 		 278 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2839  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  48.55 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604596  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0950  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  45.93 
 
 		 280 aa  262  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.73185  hitchhiker  0.0000165673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3017  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  47.08 
 
 		 274 aa  262  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0391  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  44.32 
 
 		 276 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2031  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  44.24 
 
 		 278 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3915  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  43.17 
 
 		 278 aa  258  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4263  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.01 
 
 		 274 aa  258  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1972  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.4 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.902549  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2539  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  45.94 
 
 		 283 aa  257  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4107  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  43.53 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1757  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  45.58 
 
 		 283 aa  245  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1280  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  40.73 
 
 		 276 aa  237  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000894745  normal  0.234685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03676  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  54.29 
 
 		 73 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03675  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  39.32 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  27.96 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.13 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  30.07 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  29.77 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  27.7 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  32.17 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  26.11 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  27.86 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  27.5 
 
 		 297 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  27.78 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>