91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3076 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  100 
 
 
270 aa  551  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5565  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  77.53 
 
 
282 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8492  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  73.33 
 
 
273 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  58.55 
 
 
286 aa  317  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2744  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  56.94 
 
 
303 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4057  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  52.45 
 
 
304 aa  301  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1724  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  60.63 
 
 
256 aa  295  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4540  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  52.58 
 
 
311 aa  292  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5450  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  57.45 
 
 
305 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383375  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3607  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  53.38 
 
 
292 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  53.41 
 
 
292 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  52.33 
 
 
289 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  51.38 
 
 
297 aa  270  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  48.97 
 
 
300 aa  258  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1801  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  53.62 
 
 
314 aa  256  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.359842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6847  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  51.76 
 
 
292 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0727  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  48.28 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  45.13 
 
 
307 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3317  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.56 
 
 
265 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  39.03 
 
 
287 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1525  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  41.8 
 
 
278 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5746  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  40.77 
 
 
276 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0979  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  39.92 
 
 
265 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1700  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.16 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1717  myo-inositol catabolism IolB region  42.91 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.26 
 
 
285 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1237  putative myo-inositol catabolism protein  42.02 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  40.8 
 
 
271 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1132  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.71 
 
 
265 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1300  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40 
 
 
272 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  41 
 
 
267 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.48 
 
 
272 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0984  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.08 
 
 
267 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.860916 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  40.08 
 
 
272 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.08 
 
 
272 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.28 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1587  myo-inositol catabolism protein  39.69 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000101731  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0068  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  41.38 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00478014  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3840  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.8 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1895  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.08 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.211847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  40.23 
 
 
266 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  40.54 
 
 
267 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  40.54 
 
 
267 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0672  iolB protein  39.2 
 
 
269 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0455  myo-inositol catabolism IolB region  40.4 
 
 
271 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2812  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  39.06 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0555843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4702  protein IolB  40.24 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000356278  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  40.15 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  40.15 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  40.15 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  40.15 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  40.15 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.8 
 
 
266 aa  131  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3559  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.71 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0080  hypothetical protein  39.44 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1343  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  39.69 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4662  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.04 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1672  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.35 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1598  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.8 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2994  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.64 
 
 
276 aa  126  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7801  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.98 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1279  myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.95 
 
 
270 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286667  normal  0.249496 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.78 
 
 
268 aa  122  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50060  Myo-inositol catabolism protein IolB  38.62 
 
 
275 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3498  iolB protein  36.44 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1868  hypothetical protein  36.76 
 
 
271 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0212123 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3286  hypothetical protein  38 
 
 
268 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2313  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.98 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3039  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.36 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2967  putative myo-inositol catabolism protein IolB  36.36 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3332  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.25 
 
 
275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1429  myo-inositol catabolism IolB protein  37.8 
 
 
272 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191382  normal  0.741478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3272  myo-inositol catabolism IolB  34.18 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258514  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1576  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.57 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0278  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.42 
 
 
265 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  33.97 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0499  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  31.95 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777843  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  30.97 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3350  myo-inositol catabolism IolB protein  29.61 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497522  normal  0.203778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1418  myo-inositol catabolism IolB protein  27.98 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0783277  normal  0.109536 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0083  putative myo-inositol catabolism protein IolB  22.79 
 
 
255 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1267  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  55.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647401  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1777  protein involved in inositol metabolism-like protein  30.04 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2407  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  34.13 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0670  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol- isomerase  24.53 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4017  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  21.33 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0372282  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0482  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  30.77 
 
 
274 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2134  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  30.77 
 
 
274 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2257  myo-inositol catabolism protein  19.83 
 
 
263 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>