94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1717 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1717  myo-inositol catabolism IolB region  100 
 
 
265 aa  527  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1525  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  55.17 
 
 
278 aa  296  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3559  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.68 
 
 
291 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5746  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  52.83 
 
 
276 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  54.15 
 
 
266 aa  265  8e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0979  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  52.99 
 
 
265 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1132  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  53.39 
 
 
265 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0080  hypothetical protein  50.4 
 
 
272 aa  257  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1587  myo-inositol catabolism protein  50.38 
 
 
276 aa  257  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000101731  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0672  iolB protein  51.97 
 
 
269 aa  256  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3840  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  51.19 
 
 
269 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1598  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  50.19 
 
 
271 aa  255  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0068  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.31 
 
 
275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00478014  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  51.12 
 
 
271 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2994  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  50.75 
 
 
276 aa  250  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1672  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  50.6 
 
 
268 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0455  myo-inositol catabolism IolB region  48.31 
 
 
271 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  51.52 
 
 
267 aa  248  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  51.12 
 
 
272 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3317  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  51.97 
 
 
265 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1343  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  50.75 
 
 
278 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1300  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  51.12 
 
 
272 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1868  hypothetical protein  50.75 
 
 
271 aa  246  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0212123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1237  putative myo-inositol catabolism protein  51.87 
 
 
271 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7801  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  49.06 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3332  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  51.88 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2967  putative myo-inositol catabolism protein IolB  50 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3039  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  50 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1895  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  50.75 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.211847 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  50.37 
 
 
272 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  50.37 
 
 
272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  50 
 
 
267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  50.37 
 
 
272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4662  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  49.25 
 
 
273 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  50 
 
 
267 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  50 
 
 
267 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  50 
 
 
267 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  50 
 
 
267 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  50 
 
 
267 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  49.62 
 
 
267 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  48.22 
 
 
268 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  49.6 
 
 
268 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1429  myo-inositol catabolism IolB protein  52.57 
 
 
272 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191382  normal  0.741478 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3286  hypothetical protein  49.6 
 
 
268 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  48.22 
 
 
266 aa  234  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2812  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  47.83 
 
 
266 aa  232  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0555843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0984  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  48.12 
 
 
267 aa  231  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.860916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2313  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  48.99 
 
 
264 aa  228  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1279  myo-inositol catabolism IolB domain protein  47.37 
 
 
270 aa  228  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286667  normal  0.249496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50060  Myo-inositol catabolism protein IolB  47.6 
 
 
275 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3272  myo-inositol catabolism IolB  46.49 
 
 
269 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258514  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3498  iolB protein  46.67 
 
 
269 aa  222  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4702  protein IolB  45.49 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000356278  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  45.85 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1700  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  45.99 
 
 
276 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.98 
 
 
268 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1576  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  42.86 
 
 
270 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.6 
 
 
287 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0278  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  42.02 
 
 
265 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.11 
 
 
276 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5450  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  41.03 
 
 
305 aa  168  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383375  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  42.4 
 
 
286 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3607  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  42.02 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1801  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  43.18 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.359842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  42.8 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2744  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  42.8 
 
 
303 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  39.76 
 
 
280 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  40.94 
 
 
297 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0499  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.33 
 
 
275 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777843  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6847  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  41 
 
 
292 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5565  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  41.67 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8492  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  42.46 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1724  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  41.8 
 
 
256 aa  151  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  42.91 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0727  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  40.75 
 
 
302 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.43 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.13 
 
 
292 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4057  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37 
 
 
304 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.58 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4540  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.61 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1418  myo-inositol catabolism IolB protein  33.18 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0783277  normal  0.109536 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3350  myo-inositol catabolism IolB protein  31.84 
 
 
280 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497522  normal  0.203778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1267  hypothetical protein  30.59 
 
 
286 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647401  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  25 
 
 
628 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  25 
 
 
628 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0083  putative myo-inositol catabolism protein IolB  24.3 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4017  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  24.81 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0372282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2257  myo-inositol catabolism protein  26 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543687  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0306  myo-inositol catabolism protein  27.75 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1777  protein involved in inositol metabolism-like protein  27.4 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2301  myo-inositol catabolism protein  26.04 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2517  myo-inositol catabolism protein IolB  26.04 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2533  putative iolB protein  26.04 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61055e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2338  iolB protein  26.04 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>