95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5701 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  100 
 
 		 287 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1525  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  41 
 
 		 278 aa  202  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1717  myo-inositol catabolism IolB region  38.6 
 
 		 265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1587  myo-inositol catabolism protein  38.18 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000101731  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1672  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.95 
 
 		 268 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5746  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.76 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3559  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.55 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.41 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0979  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.43 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0984  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.25 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1132  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.69 
 
 		 265 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1598  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.85 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  37.82 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.57 
 
 		 272 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  38.57 
 
 		 272 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.98 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1700  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.06 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.13 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0068  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.32 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00478014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1300  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.78 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7801  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.43 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.41 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1895  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.77 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211847 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  34.96 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  34.96 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  34.96 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  34.96 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  34.96 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  33.58 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1237  putative myo-inositol catabolism protein  36.3 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  34.96 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  34.96 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  34.59 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3317  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.06 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4702  protein IolB  35.82 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000356278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50060  Myo-inositol catabolism protein IolB  35.53 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0672  iolB protein  34.81 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3498  iolB protein  38.15 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8492  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.66 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4662  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.56 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1279  myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.57 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286667  normal  0.249496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  33.96 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2812  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.34 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0555843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3840  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.07 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3272  myo-inositol catabolism IolB  37.75 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.16 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.57 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1576  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.73 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5450  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.95 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3607  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.13 
 
 		 292 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3286  hypothetical protein  34.57 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0080  hypothetical protein  33.7 
 
 		 272 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2994  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.19 
 
 		 276 aa  158  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0455  myo-inositol catabolism IolB region  34.81 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2313  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  33.96 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1801  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.35 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.359842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.64 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4540  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.31 
 
 		 311 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1343  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.06 
 
 		 278 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5565  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.77 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.03 
 
 		 270 aa  155  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1868  hypothetical protein  34.07 
 
 		 271 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0212123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  31.9 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3039  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  33.33 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2967  putative myo-inositol catabolism protein IolB  33.33 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3332  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  33.33 
 
 		 275 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2744  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.04 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.66 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.18 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.29 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1429  myo-inositol catabolism IolB protein  33.21 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191382  normal  0.741478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  32.95 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4057  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  31.54 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0278  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.3 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6847  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  31.43 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0499  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  30.49 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1724  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.35 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  29.55 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0727  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  32.62 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  32.91 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1418  myo-inositol catabolism IolB protein  28.23 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0783277  normal  0.109536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1267  hypothetical protein  26.53 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647401  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3350  myo-inositol catabolism IolB protein  25.38 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497522  normal  0.203778 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0083  putative myo-inositol catabolism protein IolB  24.7 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2338  iolB protein  24.23 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473795  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0306  myo-inositol catabolism protein  24.23 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2517  myo-inositol catabolism protein IolB  24.23 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2301  myo-inositol catabolism protein  24.23 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2533  putative iolB protein  24.23 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61055e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2257  myo-inositol catabolism protein  23.79 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4017  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  28.57 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0372282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1777  protein involved in inositol metabolism-like protein  26.62 
 
 		 246 aa  48.9  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  22.58 
 
 		 628 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  22.22 
 
 		 628 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2407  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  26.11 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>