112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3607 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3607  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  100 
 
 
292 aa  599  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  73.68 
 
 
292 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  73.78 
 
 
289 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2744  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  66.67 
 
 
303 aa  391  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4057  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  61.09 
 
 
304 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  58.3 
 
 
286 aa  326  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  59.7 
 
 
300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  55.36 
 
 
297 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5565  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  56 
 
 
282 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  53.38 
 
 
270 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4540  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  51.84 
 
 
311 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8492  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  55.36 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1801  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  50.17 
 
 
314 aa  259  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.359842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0727  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  50.17 
 
 
302 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1724  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  50.96 
 
 
256 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5450  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  46.23 
 
 
305 aa  235  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383375  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  48.51 
 
 
307 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6847  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  49.45 
 
 
292 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1525  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  40.21 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5746  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.18 
 
 
276 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1717  myo-inositol catabolism IolB region  42.02 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3317  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.16 
 
 
265 aa  162  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.13 
 
 
287 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0068  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  41.57 
 
 
275 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00478014  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1598  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.84 
 
 
271 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.62 
 
 
272 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  39.08 
 
 
271 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  40.62 
 
 
272 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.62 
 
 
272 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3559  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.69 
 
 
291 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0672  iolB protein  38.82 
 
 
269 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  41.02 
 
 
272 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1300  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.62 
 
 
272 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1895  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.08 
 
 
272 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.211847 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3840  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.04 
 
 
269 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1587  myo-inositol catabolism protein  39.15 
 
 
276 aa  151  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000101731  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0080  hypothetical protein  38.43 
 
 
272 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1237  putative myo-inositol catabolism protein  39.69 
 
 
271 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0979  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.65 
 
 
265 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1700  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.66 
 
 
276 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0455  myo-inositol catabolism IolB region  38.04 
 
 
271 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1279  myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.19 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286667  normal  0.249496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1132  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.47 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7801  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.65 
 
 
271 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2313  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.2 
 
 
264 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0984  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.33 
 
 
267 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.860916 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.65 
 
 
268 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.78 
 
 
285 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3286  hypothetical protein  37.65 
 
 
268 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4662  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.55 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1343  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.52 
 
 
278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2994  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.19 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  37.5 
 
 
267 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1672  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.34 
 
 
268 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2967  putative myo-inositol catabolism protein IolB  36.64 
 
 
271 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3039  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.64 
 
 
271 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1868  hypothetical protein  36.64 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0212123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3498  iolB protein  41.39 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.28 
 
 
266 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1576  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.34 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  35.55 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3272  myo-inositol catabolism IolB  39.59 
 
 
269 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258514  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  32.82 
 
 
268 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3332  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.43 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  35.55 
 
 
267 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  35.55 
 
 
267 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  35.55 
 
 
267 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  35.55 
 
 
267 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  35.55 
 
 
267 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  35.55 
 
 
267 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.35 
 
 
268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4702  protein IolB  36.61 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000356278  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2812  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.61 
 
 
266 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0555843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  36.47 
 
 
266 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1429  myo-inositol catabolism IolB protein  36.14 
 
 
272 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191382  normal  0.741478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50060  Myo-inositol catabolism protein IolB  36.73 
 
 
275 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  34.57 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0278  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.15 
 
 
265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.02 
 
 
276 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0499  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  31.95 
 
 
275 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777843  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1267  hypothetical protein  27.05 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647401  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1418  myo-inositol catabolism IolB protein  26.27 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0783277  normal  0.109536 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3350  myo-inositol catabolism IolB protein  27.73 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497522  normal  0.203778 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0083  putative myo-inositol catabolism protein IolB  21.63 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6827  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  26.45 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4744  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  26.44 
 
 
281 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00116126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3894  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  26 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.787438  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0306  myo-inositol catabolism protein  22.58 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2257  myo-inositol catabolism protein  22.04 
 
 
263 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4017  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  21.63 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0372282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2338  iolB protein  22.12 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2301  myo-inositol catabolism protein  22.12 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2517  myo-inositol catabolism protein IolB  22.12 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2533  putative iolB protein  22.12 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61055e-21 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0643  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  29.63 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3403  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  23.75 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0682424 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1777  protein involved in inositol metabolism-like protein  28.1 
 
 
246 aa  47  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2990  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24.68 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0872  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24.68 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2991  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  23.72 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.050045 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>