94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0080 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0080  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  568  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3840  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  83.64 
 
 		 269 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0672  iolB protein  84.39 
 
 		 269 aa  487  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0455  myo-inositol catabolism IolB region  79.1 
 
 		 271 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1672  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  70.3 
 
 		 268 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1279  myo-inositol catabolism IolB domain protein  67.79 
 
 		 270 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286667  normal  0.249496 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  68.16 
 
 		 268 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7801  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  66.42 
 
 		 271 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3286  hypothetical protein  68.16 
 
 		 268 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2313  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  68.34 
 
 		 264 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1429  myo-inositol catabolism IolB protein  67.42 
 
 		 272 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191382  normal  0.741478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3559  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  57.58 
 
 		 291 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1132  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  55.85 
 
 		 265 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0979  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  55.85 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1598  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  53.16 
 
 		 271 aa  292  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3317  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  47.55 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  52.42 
 
 		 266 aa  265  8e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1587  myo-inositol catabolism protein  50.19 
 
 		 276 aa  261  8e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000101731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5746  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  49.44 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1717  myo-inositol catabolism IolB region  50.4 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1343  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  50.6 
 
 		 278 aa  255  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  48.48 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3272  myo-inositol catabolism IolB  48.7 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4702  protein IolB  48.33 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000356278  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  46.42 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2994  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  48.5 
 
 		 276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50060  Myo-inositol catabolism protein IolB  48.79 
 
 		 275 aa  251  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3498  iolB protein  50.61 
 
 		 269 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  48.11 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  48.11 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  48.11 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  48.11 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  48.11 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  48.11 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4662  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  46.42 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  48.02 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  47.31 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1300  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  46.47 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  47.31 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  47.17 
 
 		 266 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  48.11 
 
 		 267 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  46.72 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  47.31 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3332  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  49.8 
 
 		 275 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1895  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  47.83 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1237  putative myo-inositol catabolism protein  47.83 
 
 		 271 aa  245  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1868  hypothetical protein  49.06 
 
 		 271 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0212123 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2967  putative myo-inositol catabolism protein IolB  49.06 
 
 		 271 aa  244  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3039  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  49.06 
 
 		 271 aa  244  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0984  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  45.49 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0068  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  46.22 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00478014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2812  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  46.42 
 
 		 266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0555843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1525  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  43.03 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  33.76 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1576  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.27 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  33.7 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.5 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0499  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.66 
 
 		 275 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.08 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1700  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.45 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3607  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.43 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.37 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.98 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5450  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.61 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1801  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.7 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.359842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.11 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2744  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.89 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.54 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4540  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.48 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0278  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.31 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6847  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.63 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1724  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.96 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.44 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4057  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.38 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5565  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.57 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8492  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.25 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.32 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  33.09 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0727  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  33.95 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3350  myo-inositol catabolism IolB protein  31.09 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497522  normal  0.203778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1418  myo-inositol catabolism IolB protein  29.66 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0783277  normal  0.109536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  33.33 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1267  hypothetical protein  29.51 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647401  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2257  myo-inositol catabolism protein  24.9 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2338  iolB protein  24.9 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2301  myo-inositol catabolism protein  24.9 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2517  myo-inositol catabolism protein IolB  24.9 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2533  putative iolB protein  24.9 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61055e-21 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0306  myo-inositol catabolism protein  25.81 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1777  protein involved in inositol metabolism-like protein  28.64 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0083  putative myo-inositol catabolism protein IolB  24.9 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4017  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  20.95 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0372282  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  24.8 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  24.8 
 
 		 628 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>