115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0835 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  85 
 
 		 297 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3607  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  59.7 
 
 		 292 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  57.14 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  55.39 
 
 		 292 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2744  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  54.45 
 
 		 303 aa  299  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4057  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  52.84 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.81 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  54.82 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4540  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  48.47 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  48.97 
 
 		 270 aa  258  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5565  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  49.48 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8492  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  49.15 
 
 		 273 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1801  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  50.9 
 
 		 314 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.359842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1724  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  50.57 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0727  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  50.18 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5450  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  42.81 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6847  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  43.19 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1525  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  40.91 
 
 		 278 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1717  myo-inositol catabolism IolB region  42.8 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3317  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  41.25 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  39.93 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1300  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.64 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.28 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.28 
 
 		 272 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0068  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  42.41 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00478014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1598  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.53 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  39.93 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.93 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5746  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  41.47 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1895  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40.64 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1237  putative myo-inositol catabolism protein  39.93 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  41.8 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1587  myo-inositol catabolism protein  39.38 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000101731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.66 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3840  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.25 
 
 		 269 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0672  iolB protein  36.67 
 
 		 269 aa  145  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0984  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.46 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2994  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  39.06 
 
 		 276 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.5 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1672  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.21 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2967  putative myo-inositol catabolism protein IolB  39.08 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3039  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.08 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1868  hypothetical protein  39.08 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0212123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1343  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  39.69 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4662  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.22 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4702  protein IolB  39.15 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000356278  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  39.45 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2313  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.55 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  39.45 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  39.45 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  39.45 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  39.45 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  39.45 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  39.45 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.89 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0979  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.08 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7801  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.43 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1132  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.19 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3332  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.28 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3559  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.6 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1279  myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.11 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286667  normal  0.249496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.2 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1700  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.23 
 
 		 276 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.72 
 
 		 268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1576  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.88 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3286  hypothetical protein  36.33 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0455  myo-inositol catabolism IolB region  35.27 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0080  hypothetical protein  34.32 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1429  myo-inositol catabolism IolB protein  36.25 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191382  normal  0.741478 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.65 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  36.86 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2812  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.86 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0555843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3272  myo-inositol catabolism IolB  34.3 
 
 		 269 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3498  iolB protein  35.19 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50060  Myo-inositol catabolism protein IolB  33.21 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  30.66 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  30.08 
 
 		 276 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0278  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  30.11 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0499  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  27.82 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1418  myo-inositol catabolism IolB protein  28.74 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0783277  normal  0.109536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1267  hypothetical protein  29.1 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647401  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3350  myo-inositol catabolism IolB protein  27.85 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497522  normal  0.203778 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2257  myo-inositol catabolism protein  25.12 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543687  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0306  myo-inositol catabolism protein  24.56 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2338  iolB protein  24.12 
 
 		 263 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2301  myo-inositol catabolism protein  24.12 
 
 		 263 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2517  myo-inositol catabolism protein IolB  24.12 
 
 		 263 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2533  putative iolB protein  24.12 
 
 		 263 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61055e-21 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0847  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  30.77 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2990  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  30.77 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0872  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  30.77 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0083  putative myo-inositol catabolism protein IolB  19.39 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4112  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  30.77 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000651475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3017  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  30.71 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3894  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.78 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.787438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2991  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.66 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.050045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4017  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  20.53 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0372282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02691  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  30.07 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02654  hypothetical protein  30.07 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>