94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1279 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1279  myo-inositol catabolism IolB domain protein  100 
 
 		 270 aa  557  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286667  normal  0.249496 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  71.27 
 
 		 268 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0672  iolB protein  70.41 
 
 		 269 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3286  hypothetical protein  71.27 
 
 		 268 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0080  hypothetical protein  67.79 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3840  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  67.42 
 
 		 269 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7801  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  67.29 
 
 		 271 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2313  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  68.85 
 
 		 264 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0455  myo-inositol catabolism IolB region  64.68 
 
 		 271 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1672  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  68.18 
 
 		 268 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1429  myo-inositol catabolism IolB protein  68.6 
 
 		 272 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191382  normal  0.741478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0979  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  53.21 
 
 		 265 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1132  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  52.85 
 
 		 265 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3559  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  53.23 
 
 		 291 aa  281  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5746  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  51.11 
 
 		 276 aa  268  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  52.31 
 
 		 266 aa  265  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1343  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  52.19 
 
 		 278 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1587  myo-inositol catabolism protein  49.61 
 
 		 276 aa  261  6.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000101731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2994  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  50.57 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3317  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  48.41 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3332  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  50.94 
 
 		 275 aa  254  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4702  protein IolB  47.94 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000356278  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1598  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  44.7 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0068  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  49.8 
 
 		 275 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00478014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4662  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  48.61 
 
 		 273 aa  245  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  47.94 
 
 		 271 aa  244  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1868  hypothetical protein  49.43 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0212123 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2967  putative myo-inositol catabolism protein IolB  49.06 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3039  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  49.06 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1300  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  47.49 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  43.07 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  47.15 
 
 		 272 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  47.15 
 
 		 272 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  47.1 
 
 		 272 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  47.15 
 
 		 272 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1237  putative myo-inositol catabolism protein  49.8 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1895  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  46.9 
 
 		 272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0984  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  46 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1717  myo-inositol catabolism IolB region  47.37 
 
 		 265 aa  228  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1525  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  43.56 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  45.21 
 
 		 267 aa  225  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50060  Myo-inositol catabolism protein IolB  45.72 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3498  iolB protein  44.94 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3272  myo-inositol catabolism IolB  44.07 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  44.44 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  44.44 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  44.44 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  44.44 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  44.44 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  44.44 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  41.89 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  44.44 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2812  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  41.51 
 
 		 266 aa  215  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0555843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  39.92 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.57 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1700  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.83 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  31.09 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  40 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0499  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.66 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3607  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.19 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.78 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1576  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.94 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.32 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.15 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.4 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5450  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.05 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1724  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.65 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4540  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.72 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1801  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.45 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.359842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.11 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2744  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.22 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5565  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.15 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0278  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  32.64 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4057  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  33.58 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8492  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.15 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.95 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6847  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.69 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  32.6 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.75 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0727  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.26 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1418  myo-inositol catabolism IolB protein  29.83 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0783277  normal  0.109536 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3350  myo-inositol catabolism IolB protein  28.87 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497522  normal  0.203778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1267  hypothetical protein  29.67 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647401  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2257  myo-inositol catabolism protein  24.59 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543687  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0306  myo-inositol catabolism protein  24.59 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2338  iolB protein  26.85 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2301  myo-inositol catabolism protein  26.85 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2517  myo-inositol catabolism protein IolB  26.85 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2533  putative iolB protein  26.85 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61055e-21 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1777  protein involved in inositol metabolism-like protein  28.81 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4017  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  20 
 
 		 262 aa  52.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0372282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0083  putative myo-inositol catabolism protein IolB  20.74 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  21.72 
 
 		 628 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  21.78 
 
 		 628 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>