94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3559 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3559  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  100 
 
 		 291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0979  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  71.86 
 
 		 265 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1132  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  71.86 
 
 		 265 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0455  myo-inositol catabolism IolB region  57.2 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0080  hypothetical protein  57.58 
 
 		 272 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3840  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  56.44 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0672  iolB protein  56.82 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  57.48 
 
 		 266 aa  295  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1343  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  57.74 
 
 		 278 aa  295  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2994  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  56.98 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5746  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  55.47 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7801  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  54.14 
 
 		 271 aa  292  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1672  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.2 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  52.87 
 
 		 268 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1598  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.51 
 
 		 271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.17 
 
 		 268 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3286  hypothetical protein  54.17 
 
 		 268 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3317  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.41 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2967  putative myo-inositol catabolism protein IolB  56.6 
 
 		 271 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3039  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  56.6 
 
 		 271 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1868  hypothetical protein  55.85 
 
 		 271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0212123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4662  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.31 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3332  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  56.23 
 
 		 275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1279  myo-inositol catabolism IolB domain protein  53.23 
 
 		 270 aa  281  9e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286667  normal  0.249496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  51.91 
 
 		 266 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  53.01 
 
 		 272 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  51.89 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  52.83 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1717  myo-inositol catabolism IolB region  54.68 
 
 		 265 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1587  myo-inositol catabolism protein  52.81 
 
 		 276 aa  276  4e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000101731  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  52.63 
 
 		 272 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  52.63 
 
 		 272 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2812  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  51.91 
 
 		 266 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0555843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50060  Myo-inositol catabolism protein IolB  52.61 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2313  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.33 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3272  myo-inositol catabolism IolB  51.67 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1895  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  53.01 
 
 		 272 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211847 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  52.63 
 
 		 272 aa  271  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1237  putative myo-inositol catabolism protein  53.93 
 
 		 271 aa  271  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  50.76 
 
 		 267 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1300  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  52.63 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  50.76 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  50.76 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  50.76 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  50.76 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  50.76 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1429  myo-inositol catabolism IolB protein  54.9 
 
 		 272 aa  268  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191382  normal  0.741478 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  50.38 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3498  iolB protein  50.37 
 
 		 269 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4702  protein IolB  52.09 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000356278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0068  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  53.63 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00478014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0984  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  49.24 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1525  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  43.89 
 
 		 278 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.55 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.4 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  40.42 
 
 		 285 aa  171  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.77 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1576  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  39.39 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0499  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.07 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3607  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  39.69 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0278  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.01 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1700  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.59 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2744  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  38.19 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.69 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6847  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  39.22 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5450  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.01 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.92 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8492  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.11 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.6 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.71 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  34.08 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.19 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4057  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.94 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1724  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.55 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5565  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  38.49 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.19 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1801  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.41 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.359842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0727  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.72 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4540  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  31.82 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1418  myo-inositol catabolism IolB protein  29.27 
 
 		 279 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0783277  normal  0.109536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  33.46 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3350  myo-inositol catabolism IolB protein  31.39 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497522  normal  0.203778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1267  hypothetical protein  30.13 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647401  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0306  myo-inositol catabolism protein  25.35 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2257  myo-inositol catabolism protein  25.23 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2338  iolB protein  24.31 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2301  myo-inositol catabolism protein  24.77 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2517  myo-inositol catabolism protein IolB  24.31 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2533  putative iolB protein  24.77 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61055e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0083  putative myo-inositol catabolism protein IolB  25.63 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4017  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  22.94 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0372282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1777  protein involved in inositol metabolism-like protein  29.94 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  24.36 
 
 		 628 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  24.12 
 
 		 628 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>