93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1368 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  100 
 
 		 307 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.82 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  54.03 
 
 		 297 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  48.19 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  48.7 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3607  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  48.51 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8492  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  44.95 
 
 		 273 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  45.13 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5565  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  44.72 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2744  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  47.1 
 
 		 303 aa  225  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4057  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  44.48 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  45.39 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1724  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  45.42 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1801  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  46.95 
 
 		 314 aa  209  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.359842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4540  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  43.84 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0727  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  42.76 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6847  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  44.69 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5450  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  42.24 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1717  myo-inositol catabolism IolB region  36.58 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5746  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.6 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1525  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  31.92 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  35.8 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  35.91 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  35.91 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  35.02 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  35.91 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  35.91 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  35.02 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  35.91 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1576  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.16 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  35.02 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0068  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.07 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00478014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3317  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.38 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.22 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4702  protein IolB  35.55 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000356278  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  33.33 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2812  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.88 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0555843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1598  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  32.38 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0984  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.4 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1279  myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.75 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286667  normal  0.249496 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.85 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.23 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3840  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  33.07 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1895  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.85 
 
 		 272 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211847 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7801  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.75 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4662  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.77 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1300  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.47 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.65 
 
 		 266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1587  myo-inositol catabolism protein  33.08 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000101731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  34.47 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.47 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1237  putative myo-inositol catabolism protein  34.63 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0672  iolB protein  32.81 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2967  putative myo-inositol catabolism protein IolB  32.31 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3039  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  32.31 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1868  hypothetical protein  32.31 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0212123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3498  iolB protein  35.06 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2994  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  33.98 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3332  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  33.2 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2313  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.06 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  34.5 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3272  myo-inositol catabolism IolB  34 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.24 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3286  hypothetical protein  34.24 
 
 		 268 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1672  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  31.64 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1700  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  31.82 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1343  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  33.98 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0979  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.71 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  32.91 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  31.44 
 
 		 268 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1132  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.24 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0455  myo-inositol catabolism IolB region  32.05 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1429  myo-inositol catabolism IolB protein  31.47 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191382  normal  0.741478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3559  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  33.46 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50060  Myo-inositol catabolism protein IolB  34.27 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  32.37 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0278  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  32.78 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0499  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  28.81 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  29.41 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3894  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  32.33 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.787438  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1418  myo-inositol catabolism IolB protein  28.38 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0783277  normal  0.109536 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3350  myo-inositol catabolism IolB protein  26.55 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497522  normal  0.203778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2134  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  32.09 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0482  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  32.09 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1267  hypothetical protein  25.96 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647401  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4744  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.89 
 
 		 281 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2407  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  32.17 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2257  myo-inositol catabolism protein  24.53 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2517  myo-inositol catabolism protein IolB  24.53 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2338  iolB protein  24.53 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2533  putative iolB protein  23.9 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61055e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2301  myo-inositol catabolism protein  23.9 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>