74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2738 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2738  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  100 
 
 		 276 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4264  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  59.71 
 
 		 279 aa  358  6e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.968678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0399  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  59.78 
 
 		 276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0395  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  60.14 
 
 		 276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0395  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  59.42 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0670  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol- isomerase  58.33 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2384  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  58.33 
 
 		 276 aa  348  5e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0391  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  59.06 
 
 		 276 aa  348  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02654  hypothetical protein  57.19 
 
 		 278 aa  348  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02691  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  57.19 
 
 		 278 aa  348  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0119  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomer ase  56.88 
 
 		 278 aa  348  6e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4112  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  57.55 
 
 		 278 aa  347  8e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000651475 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0872  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  57.19 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2990  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  57.19 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2991  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  57.19 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.050045 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3165  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  57.19 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0847  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  57.19 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6827  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.64 
 
 		 278 aa  346  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2944  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  56.52 
 
 		 280 aa  345  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.842443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3296  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  56.47 
 
 		 278 aa  344  8e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.578239  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3249  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  56.47 
 
 		 278 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3234  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  56.47 
 
 		 278 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3186  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  56.47 
 
 		 278 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3350  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  56.47 
 
 		 278 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.40902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3169  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  56.47 
 
 		 278 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3403  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  56.16 
 
 		 286 aa  335  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0682424 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2203  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.76 
 
 		 278 aa  335  5e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3017  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.4 
 
 		 274 aa  331  9e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1804  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  54.68 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0956788  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1694  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  54.68 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.730903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2642  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  54.32 
 
 		 278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.198375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2206  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.4 
 
 		 278 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1910  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  53.96 
 
 		 278 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000905199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3915  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  52.16 
 
 		 278 aa  325  7e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1710  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  52.54 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5662  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  52.54 
 
 		 278 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4107  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  52.16 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2031  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  53.96 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6603  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  51.45 
 
 		 278 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0950  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  53.21 
 
 		 280 aa  316  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.73185  hitchhiker  0.0000165673 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0343  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  52.9 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1972  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.04 
 
 		 278 aa  310  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.902549  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5760  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  50 
 
 		 278 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1280  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  49.09 
 
 		 276 aa  298  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000894745  normal  0.234685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1757  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  50.91 
 
 		 283 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2134  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  49.64 
 
 		 274 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0482  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  49.64 
 
 		 274 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0197  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  48.39 
 
 		 279 aa  295  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4744  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  50 
 
 		 281 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2407  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  49.28 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3894  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  48.91 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.787438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2839  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  51.45 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604596  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2539  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  49.82 
 
 		 283 aa  282  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0643  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  44.77 
 
 		 272 aa  268  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4263  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  44.77 
 
 		 274 aa  255  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03675  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  44.92 
 
 		 145 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03676  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  60 
 
 		 73 aa  96.3  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  26.39 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  31.29 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2302  5-keto 4-deoxyuronate isomerase-like protein  25.48 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  27.78 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  31.58 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  31.58 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  31.58 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  31.58 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  31.58 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  31.58 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  24.57 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  29.37 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  31.58 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  29.59 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  24.81 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  26.92 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  26.52 
 
 		 292 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>