59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1804 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1694  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  100 
 
 		 278 aa  583  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.730903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1804  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  100 
 
 		 278 aa  583  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0956788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2642  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  99.64 
 
 		 278 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.198375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1910  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  84.53 
 
 		 278 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000905199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2203  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  84.17 
 
 		 278 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2031  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  82.01 
 
 		 278 aa  500  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1972  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  83.81 
 
 		 278 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.902549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3165  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  80.94 
 
 		 278 aa  487  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2991  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  81.29 
 
 		 278 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.050045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02691  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  80.58 
 
 		 278 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2990  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  80.22 
 
 		 278 aa  484  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0872  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  80.22 
 
 		 278 aa  484  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02654  hypothetical protein  80.58 
 
 		 278 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0847  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  80.22 
 
 		 278 aa  484  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4112  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  79.86 
 
 		 278 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000651475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3296  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  79.14 
 
 		 278 aa  480  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.578239  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3017  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  78.78 
 
 		 274 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3350  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  75.9 
 
 		 278 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.40902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3169  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  75.9 
 
 		 278 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3186  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  75.9 
 
 		 278 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3234  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  75.9 
 
 		 278 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037687 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3249  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  75.9 
 
 		 278 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2206  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  71.22 
 
 		 278 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5760  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  69.06 
 
 		 278 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4107  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  69.42 
 
 		 278 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3915  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  69.06 
 
 		 278 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2944  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  58.99 
 
 		 280 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.842443 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0395  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  58.63 
 
 		 276 aa  354  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0399  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  58.63 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0395  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  58.63 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0391  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  58.27 
 
 		 276 aa  351  7e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0670  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol- isomerase  56.83 
 
 		 276 aa  349  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208996  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6827  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  59.32 
 
 		 278 aa  337  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0950  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.64 
 
 		 280 aa  335  5e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.73185  hitchhiker  0.0000165673 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5662  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  52.88 
 
 		 278 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4264  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  56.36 
 
 		 279 aa  328  5.0000000000000004e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.968678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2738  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  54.68 
 
 		 276 aa  328  6e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1710  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  53.96 
 
 		 287 aa  328  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2384  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  53.6 
 
 		 276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0119  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomer ase  54.68 
 
 		 278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6603  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  52.16 
 
 		 278 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0343  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  54.68 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3403  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  54.51 
 
 		 286 aa  319  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0682424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0197  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  47.69 
 
 		 279 aa  288  8e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4744  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  48.19 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3894  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  48.2 
 
 		 273 aa  278  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.787438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2407  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.76 
 
 		 274 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2839  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  51.08 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604596  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1757  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.38 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1280  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  47.67 
 
 		 276 aa  271  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000894745  normal  0.234685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2539  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  46.32 
 
 		 283 aa  268  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0482  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  44.6 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4263  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  45.32 
 
 		 274 aa  267  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2134  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  44.6 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0643  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  43.01 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03675  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  38.46 
 
 		 145 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03676  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  55.22 
 
 		 73 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2302  5-keto 4-deoxyuronate isomerase-like protein  27.27 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929628  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  20.12 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>