56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03675 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03675  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1757  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  61.02 
 
 		 283 aa  154  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6827  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  52.59 
 
 		 278 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2738  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  44.92 
 
 		 276 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0119  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomer ase  39.39 
 
 		 278 aa  107  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4264  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  47.86 
 
 		 279 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.968678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0950  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  45.38 
 
 		 280 aa  103  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.73185  hitchhiker  0.0000165673 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6603  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  42.75 
 
 		 278 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1280  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  43.65 
 
 		 276 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000894745  normal  0.234685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0399  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  43.44 
 
 		 276 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5662  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  42.75 
 
 		 278 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0395  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  43.8 
 
 		 276 aa  100  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0391  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  43.33 
 
 		 276 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0670  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol- isomerase  42.5 
 
 		 276 aa  100  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0395  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  42.62 
 
 		 276 aa  99.4  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2944  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  41.03 
 
 		 280 aa  98.6  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.842443 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02691  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  41.88 
 
 		 278 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02654  hypothetical protein  41.88 
 
 		 278 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0343  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  39.84 
 
 		 276 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2384  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  39.85 
 
 		 276 aa  98.2  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0872  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  41.03 
 
 		 278 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2990  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  41.03 
 
 		 278 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4112  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  41.03 
 
 		 278 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000651475 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2203  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  41.03 
 
 		 278 aa  97.1  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0847  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  41.03 
 
 		 278 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2991  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  41.03 
 
 		 278 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.050045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1710  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  44.8 
 
 		 287 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2206  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  39.32 
 
 		 278 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3296  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  40.17 
 
 		 278 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.578239  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1910  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  41.03 
 
 		 278 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000905199  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3165  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  41.03 
 
 		 278 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1804  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  38.46 
 
 		 278 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0956788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2642  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  38.46 
 
 		 278 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.198375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1694  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  38.46 
 
 		 278 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.730903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3403  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  39.68 
 
 		 286 aa  88.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0682424 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3186  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  34.19 
 
 		 278 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3249  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  34.19 
 
 		 278 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3350  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  34.19 
 
 		 278 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.40902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3234  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  34.19 
 
 		 278 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3169  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  34.19 
 
 		 278 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0197  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  43.65 
 
 		 279 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2031  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  36.75 
 
 		 278 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0643  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  43.33 
 
 		 272 aa  83.6  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5760  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  35.59 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3915  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  34.45 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4744  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  40.83 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116126 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2134  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  41.03 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0482  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  41.03 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3017  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  37.61 
 
 		 274 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4107  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  34.45 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2407  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  39.32 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3894  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  38.46 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.787438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1972  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  32.48 
 
 		 278 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.902549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4263  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  34.71 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2539  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  41.54 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2839  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  32.84 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604596  normal  0.144576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>