58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2944 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2944  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  100 
 
 		 280 aa  591  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.842443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3403  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  74.19 
 
 		 286 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0682424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6827  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  71.27 
 
 		 278 aa  437  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4264  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  67.63 
 
 		 279 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.968678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0950  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  61.79 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.73185  hitchhiker  0.0000165673 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1804  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  58.99 
 
 		 278 aa  355  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0956788  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1694  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  58.99 
 
 		 278 aa  355  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.730903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2642  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  58.63 
 
 		 278 aa  354  7.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.198375 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2738  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  56.52 
 
 		 276 aa  345  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2203  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.4 
 
 		 278 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1910  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.4 
 
 		 278 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000905199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2206  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  56.12 
 
 		 278 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2991  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  56.47 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.050045 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0119  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomer ase  55.8 
 
 		 278 aa  332  4e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3165  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  56.12 
 
 		 278 aa  331  6e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2031  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  54.32 
 
 		 278 aa  332  6e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02691  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.76 
 
 		 278 aa  331  8e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02654  hypothetical protein  55.76 
 
 		 278 aa  331  8e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0847  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  55.76 
 
 		 278 aa  330  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0872  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.76 
 
 		 278 aa  330  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3296  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.76 
 
 		 278 aa  330  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.578239  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2990  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.76 
 
 		 278 aa  330  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4112  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  55.76 
 
 		 278 aa  328  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000651475 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5760  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  54.68 
 
 		 278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3350  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  54.32 
 
 		 278 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.40902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3186  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  54.32 
 
 		 278 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3249  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  54.32 
 
 		 278 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1972  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  54.68 
 
 		 278 aa  324  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.902549  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3234  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  53.96 
 
 		 278 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3169  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  54.32 
 
 		 278 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0670  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol- isomerase  53.26 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3017  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  53.96 
 
 		 274 aa  314  9e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4107  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  52.52 
 
 		 278 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3915  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  51.8 
 
 		 278 aa  310  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2384  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  52 
 
 		 276 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6603  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  49.64 
 
 		 278 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0395  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  51.09 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5662  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  50 
 
 		 278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0391  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  51.09 
 
 		 276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0399  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  51.09 
 
 		 276 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0395  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  50.73 
 
 		 276 aa  298  5e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2839  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  52.86 
 
 		 276 aa  296  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604596  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0343  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  50 
 
 		 276 aa  295  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2407  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  48.92 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3894  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  49.1 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.787438  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2134  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  48.56 
 
 		 274 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0482  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  48.56 
 
 		 274 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4744  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  49.08 
 
 		 281 aa  288  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1710  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  46.93 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1757  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  51.34 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0197  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  44.8 
 
 		 279 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1280  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  45.31 
 
 		 276 aa  261  8.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000894745  normal  0.234685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2539  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  44.88 
 
 		 283 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4263  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  43.22 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0643  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  41.52 
 
 		 272 aa  236  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03675  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  41.03 
 
 		 145 aa  98.6  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03676  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  51.43 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2302  5-keto 4-deoxyuronate isomerase-like protein  24.38 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>