73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1006 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  100 
 
 		 438 aa  875    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.62 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  26.47 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  24.62 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  28.23 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.49 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  27.78 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  27.31 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  26.44 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004270  hypothetical protein  24.23 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  26.77 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  25.51 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.1 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  31.17 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  26.97 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.15 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  23.48 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  25.57 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01160  fermentation/respiration switch protein  23.41 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0352  fermentation/respiration switch protein  27.13 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0367  fermentation/respiration switch protein  27.13 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0359  fermentation/respiration switch protein  27.13 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000175577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0357  fermentation/respiration switch protein  27.13 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0348  fermentation/respiration switch protein  27.13 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3368  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  26.43 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  25.51 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  24.41 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3342  fermentation/respiration switch protein  26.07 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00237  hypothetical protein  26.07 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0293  fermentation/respiration switch protein  26.07 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  28.81 
 
 		 326 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0266  fermentation/respiration switch protein  26.07 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00234  fermentation/respiration switch protein  26.07 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0271  fermentation/respiration switch protein  26.07 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  25.39 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  23.01 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  26.22 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0765  fermentation/respiration switch protein  27.23 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0965  fermentation/respiration switch protein  25.75 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  26.42 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0284  fermentation/respiration switch protein  26.07 
 
 		 414 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0236  fermentation/respiration switch protein  26.07 
 
 		 414 aa  55.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  26.9 
 
 		 463 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3435  fermentation/respiration switch protein  27.73 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  30.43 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.23 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  24.31 
 
 		 286 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  21.49 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  24.7 
 
 		 387 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3288  fermentation/respiration switch protein  26.71 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  26.14 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  26.14 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0976  fermentation/respiration switch protein  23.97 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  32.11 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  24.56 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  24.56 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.06 
 
 		 678 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0931  fermentation/respiration switch protein  25.49 
 
 		 415 aa  47  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.49 
 
 		 672 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  28.02 
 
 		 256 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  25.64 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  26.55 
 
 		 280 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  28.81 
 
 		 290 aa  44.3  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0898  fermentation/respiration switch protein  26.49 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.13 
 
 		 269 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  28.4 
 
 		 532 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  22.9 
 
 		 311 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 388 aa  43.9  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2300  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  26.95 
 
 		 327 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  30.77 
 
 		 401 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  22.89 
 
 		 721 aa  43.5  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.35 
 
 		 633 aa  43.1  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>