More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0226 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  100 
 
 
302 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0058  GMP synthase subunit B  70.76 
 
 
304 aa  450  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1178  GMP synthase subunit B  71.1 
 
 
305 aa  434  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0069  GMP synthase subunit B  66.78 
 
 
305 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1900  GMP synthase subunit B  65.46 
 
 
305 aa  412  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2527  GMP synthase subunit B  64.47 
 
 
305 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2139  GMP synthase subunit B  65.13 
 
 
305 aa  409  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1394  GMP synthase subunit B  66.45 
 
 
305 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216363 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2593  GMP synthase subunit B  66.12 
 
 
305 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0426  GMP synthase subunit B  66.78 
 
 
305 aa  395  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628115  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0761  GMP synthase, large subunit  64.14 
 
 
305 aa  385  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2718  GMP synthase, large subunit  66.2 
 
 
305 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0173  GMP synthase subunit B  57.88 
 
 
310 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.768744  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0027  GMP synthase subunit B  57.88 
 
 
310 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0142  GMP synthase subunit B  59.22 
 
 
310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  0.0356304 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1761  GMP synthase subunit B  58.58 
 
 
310 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0486  GMP synthase, large subunit  55.77 
 
 
312 aa  332  4e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0702  GMP synthase subunit B  58.25 
 
 
310 aa  331  8e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.34 
 
 
511 aa  318  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  52.41 
 
 
511 aa  316  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.02 
 
 
512 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  53.82 
 
 
510 aa  316  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  53.05 
 
 
517 aa  315  5e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  53.18 
 
 
512 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  52.55 
 
 
510 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  54.34 
 
 
513 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  53.5 
 
 
509 aa  312  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  53.02 
 
 
533 aa  311  5.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  55.1 
 
 
516 aa  311  6.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  53.33 
 
 
560 aa  311  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.34 
 
 
510 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  52.7 
 
 
560 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  51.75 
 
 
515 aa  310  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  52.06 
 
 
512 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  54.6 
 
 
531 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  51.25 
 
 
528 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  51.75 
 
 
515 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  51.75 
 
 
515 aa  309  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  51.75 
 
 
512 aa  309  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  51.75 
 
 
515 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  51.75 
 
 
512 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  51.75 
 
 
512 aa  309  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  51.25 
 
 
528 aa  308  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  51.75 
 
 
512 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  51.44 
 
 
510 aa  308  5e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  57.09 
 
 
501 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  54.95 
 
 
507 aa  308  6.999999999999999e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  57.09 
 
 
501 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  52.73 
 
 
513 aa  308  9e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  49.52 
 
 
511 aa  308  9e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  52.55 
 
 
516 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  52.23 
 
 
516 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  51.75 
 
 
512 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  50.31 
 
 
542 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  51.11 
 
 
512 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  51.91 
 
 
517 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  51.25 
 
 
548 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  52.5 
 
 
537 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.48 
 
 
510 aa  305  7e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  52.81 
 
 
556 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  53.18 
 
 
516 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  49.85 
 
 
528 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  53.29 
 
 
527 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  49.85 
 
 
528 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  49.85 
 
 
528 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  50.94 
 
 
542 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  52.9 
 
 
506 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  53.82 
 
 
533 aa  303  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  50.94 
 
 
542 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  54.02 
 
 
517 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  52.23 
 
 
510 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  50 
 
 
523 aa  303  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  50.31 
 
 
528 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  52.53 
 
 
514 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  54.46 
 
 
526 aa  302  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  50 
 
 
528 aa  302  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  54.25 
 
 
511 aa  301  8.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  50.16 
 
 
507 aa  301  9e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  50 
 
 
520 aa  301  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16720  GMP synthase, glutamine-hydrolyzing, C-terminal domain or B subunit  51.48 
 
 
327 aa  301  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  49.38 
 
 
575 aa  300  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1531  GMP synthase, large subunit  52.6 
 
 
327 aa  301  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  49.38 
 
 
540 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  50 
 
 
508 aa  300  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  49.68 
 
 
517 aa  300  2e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  50.46 
 
 
575 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  50 
 
 
528 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  49.2 
 
 
517 aa  299  4e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  50.8 
 
 
509 aa  298  5e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  50.8 
 
 
509 aa  298  5e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  50.32 
 
 
520 aa  299  5e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  51.72 
 
 
534 aa  298  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  51.91 
 
 
512 aa  298  7e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  49.38 
 
 
528 aa  298  9e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  51.6 
 
 
513 aa  298  9e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  50.78 
 
 
528 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  53 
 
 
540 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  53.18 
 
 
556 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  55.66 
 
 
505 aa  297  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  52.23 
 
 
512 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>