More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1345 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 252 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  69.05 
 
 		 254 aa  362  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  69.05 
 
 		 254 aa  362  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  69.44 
 
 		 253 aa  360  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  68.9 
 
 		 263 aa  359  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  68.65 
 
 		 254 aa  357  8e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  69.05 
 
 		 253 aa  357  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  68.65 
 
 		 254 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  64.26 
 
 		 280 aa  322  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  64.34 
 
 		 255 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  63.79 
 
 		 255 aa  318  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  61.57 
 
 		 255 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  61.57 
 
 		 255 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  62.7 
 
 		 255 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  57.94 
 
 		 257 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  55.95 
 
 		 277 aa  301  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  57.14 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  58.44 
 
 		 255 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  58.44 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  56.97 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  59.17 
 
 		 255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  55.56 
 
 		 252 aa  281  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  58.75 
 
 		 266 aa  281  9e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  56.25 
 
 		 256 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  55.56 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  51.39 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  51.38 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  49.18 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  49.38 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  45.24 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  45.24 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  45.24 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  45.24 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  45.34 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  45.34 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  44.31 
 
 		 273 aa  208  6e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  42.86 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  43.85 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  41.9 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  45.71 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  45.24 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  43.37 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  44.05 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  40.59 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  44.35 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  40.65 
 
 		 258 aa  184  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  43.98 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  40.64 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  40.59 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  40.87 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  40.87 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  40.71 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  41.77 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  42.32 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  40.57 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  40.17 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  40.17 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  42.68 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  42.45 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  43.78 
 
 		 261 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  43.78 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  42.32 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 249 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  39.59 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  39.59 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  39.59 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  39.75 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  40.59 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  42.13 
 
 		 264 aa  178  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  42.63 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  43.75 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  40.59 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  39.33 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  43.75 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  46.75 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1077  stationary-phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  38.74 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  41.15 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  35.04 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  35.04 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  45.93 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  41.37 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  38.34 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  41.7 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  42.11 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  41.7 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  40.62 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>