More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0769 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  493  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  65.15 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  63.07 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  62.55 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  61.32 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  61.32 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  61.73 
 
 		 259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  64.32 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  59.84 
 
 		 245 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  60.08 
 
 		 249 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  58.47 
 
 		 260 aa  288  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.2 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  51.45 
 
 		 255 aa  234  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  49.58 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  47.74 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  52.68 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  45.68 
 
 		 262 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  51.05 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  50.41 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  50 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.95 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.47 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.03 
 
 		 260 aa  225  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  48.33 
 
 		 267 aa  224  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.27 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  46.88 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  51.46 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  49.6 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  47.62 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  49.38 
 
 		 269 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.5 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  50.92 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.95 
 
 		 259 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  44.86 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  48.95 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.24 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  221  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  47.7 
 
 		 265 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  48.54 
 
 		 259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  49.41 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.18 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  51.88 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  51.5 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  50.21 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  55.11 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  53.64 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  47.5 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 		 279 aa  218  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 		 279 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  46.06 
 
 		 265 aa  218  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.81 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  49.58 
 
 		 264 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  45.8 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  51.88 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  48.92 
 
 		 278 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  51.88 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.4 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  47.22 
 
 		 287 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.15 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  51.46 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.78 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.66 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  48.35 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  48.99 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  52.47 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.75 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.79 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.44 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 251 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 267 aa  214  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  43.28 
 
 		 251 aa  214  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  48.55 
 
 		 263 aa  214  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  49.57 
 
 		 255 aa  214  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.46 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  49.32 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  49.58 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46.91 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  51.01 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  47.26 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  48.41 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  54.02 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  48.52 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  42.98 
 
 		 287 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42.98 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  42.98 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.28 
 
 		 288 aa  211  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  50.68 
 
 		 269 aa  210  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  48.1 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.66 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  45.08 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>