104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0916 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0916  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 170 aa  330  7.000000000000001e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.712591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  34.15 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.46 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.46 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.46 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  31.13 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.13 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  31.13 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  31.13 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.13 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.13 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.13 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1940  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.37 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.13 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.13 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  34.11 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  31.61 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  36.17 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  32.69 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  30.63 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.8 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.8 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  30.37 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.71 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  31.33 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  35.71 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  32.28 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  36.3 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  30.26 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  29.63 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  29.17 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  32.06 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  28.37 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.52 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  44.26 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  30.12 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  47.46 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  28.76 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  34.69 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  30.77 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  42.62 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  42.62 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  34.39 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  28.29 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  31.34 
 
 		 206 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  27.54 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  27.89 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  29.77 
 
 		 221 aa  48.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  29.53 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  31.3 
 
 		 203 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  31.11 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  26.42 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  29.23 
 
 		 209 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  29.31 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  29.11 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  28.46 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  30.6 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  27.16 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2409  hydrogenase maturation protease  32.84 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0098  hydrogenase maturation protease HydD  27.82 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0404839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  30.43 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  25.55 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.17 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1900  hydrogenase maturation protease superfamily  32.33 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  31.85 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  27.07 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  32.26 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  23.72 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  25.47 
 
 		 224 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  27.95 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  24.83 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  40.32 
 
 		 271 aa  44.7  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  43.08 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.86 
 
 		 1053 aa  44.7  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1297  hydrogenase maturation protease  25.95 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.864934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0196  hydrogenase maturation protease  25.15 
 
 		 171 aa  44.3  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0455702 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  29.01 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  27.61 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  37.1 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  26.92 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  28.4 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  36.51 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  36.51 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.12 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  27.85 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  36.51 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  36.51 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  36.51 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0408  hydrogenase maturation protease  24.84 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711224  normal  0.0552649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  24.66 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  36.51 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1433  peptidase M52, hydrogenase expression/formation protein  27.78 
 
 		 181 aa  42  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50886  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  26.36 
 
 		 214 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  38.1 
 
 		 198 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  38.1 
 
 		 198 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  36.51 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  38.1 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  38.1 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  38.1 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>