More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2127 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  88.21 
 
 
441 aa  810    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
441 aa  900    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  62.78 
 
 
449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 
431 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 
430 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 
440 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 
429 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 
431 aa  504  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 
433 aa  499  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 
440 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 
440 aa  494  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
430 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 
430 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 
430 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 
430 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
431 aa  488  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 
434 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 
434 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 
434 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 
434 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
435 aa  473  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 
434 aa  473  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 
442 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
501 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
434 aa  461  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
447 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
432 aa  458  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 
432 aa  458  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 
435 aa  461  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
432 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
448 aa  428  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
448 aa  431  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
430 aa  355  7.999999999999999e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
430 aa  327  3e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
431 aa  325  1e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
431 aa  323  3e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
431 aa  321  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
462 aa  309  6.999999999999999e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
467 aa  301  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
462 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
462 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
460 aa  294  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
466 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
463 aa  289  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
463 aa  289  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
464 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1198  asparaginyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
462 aa  288  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
463 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
472 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
466 aa  286  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04580  asparaginyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
467 aa  286  5.999999999999999e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000141691  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
466 aa  285  9e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
481 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0788  asparaginyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
477 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.742657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_42247  predicted protein  37.64 
 
 
467 aa  283  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
463 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
463 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
463 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
463 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
463 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
463 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
463 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
466 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
463 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51201  predicted protein  38.04 
 
 
503 aa  281  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.037074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
466 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
466 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
466 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
466 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
465 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
463 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
463 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  38 
 
 
467 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
467 aa  281  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
463 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
466 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
479 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
473 aa  280  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3649  asparaginyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
463 aa  280  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4810  asparaginyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
466 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
467 aa  280  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
464 aa  279  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
472 aa  280  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
472 aa  280  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  38 
 
 
466 aa  279  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  38 
 
 
466 aa  279  6e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
465 aa  279  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  38 
 
 
463 aa  279  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
466 aa  279  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000542712  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
467 aa  279  7e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>