60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1993 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1993  peptidase S24 and S26 domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1892  transcriptional regulator, XRE family  49.32 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1772  LexA repressor  39.09 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2471  LexA repressor  39.09 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.643159 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  31.93 
 
 		 153 aa  52.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1211  LexA repressor  38.18 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0805  LexA repressor  38.18 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1859  LexA repressor  38.18 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1845  LexA repressor  38.18 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0356  LexA repressor  38.18 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0456826  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1699  LexA repressor  38.18 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.465061  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2012  LexA repressor  38.18 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1630  LexA repressor  35.19 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2481  LexA repressor  38.18 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147016  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1496  LexA repressor  37.27 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1600  LexA repressor  37.27 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1516  LexA repressor  37.27 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1577  LexA repressor  37.27 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1120  LexA repressor  37.27 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4738  LexA repressor  37.27 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483588  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2425  LexA repressor  34.95 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1637  LexA repressor  36.36 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.39 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  32.62 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  29.02 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.16 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.81 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  35.96 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  29.55 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  30.77 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3151  Repressor lexA  33.04 
 
 		 154 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.662921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.56 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  29.37 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  30.51 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2636  LexA repressor  35.71 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.270851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.07 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.4 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  28.8 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  30.95 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  34.95 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.77 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  32.67 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  33.83 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.69 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  30.95 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  30.48 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  30.48 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  35.45 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0418  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.75 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000022739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  35.34 
 
 		 133 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  28 
 
 		 275 aa  42  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0426  transcriptional repressor, LexA family  42.5 
 
 		 239 aa  42  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  32.23 
 
 		 202 aa  42  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2082  LexA repressor  31.06 
 
 		 231 aa  42  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 258 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.57 
 
 		 241 aa  41.6  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  27.88 
 
 		 246 aa  41.6  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>