More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1202 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1202  family 2 glycosyl transferase  100 
 
 
239 aa  484  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.491927 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1241  glycosyl transferase family 2  69.1 
 
 
245 aa  310  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291507  normal  0.0359697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  35.15 
 
 
276 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3373  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
302 aa  93.2  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
318 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
321 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  33.84 
 
 
276 aa  89  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.72 
 
 
295 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
318 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  33.09 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.09 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.09 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  33.09 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.09 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.37 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 
1177 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 
1177 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
305 aa  82  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
299 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
330 aa  81.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.01 
 
 
310 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
294 aa  78.6  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
1015 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
727 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  44.34 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  30.05 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  27.63 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  42 
 
 
321 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
310 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 
374 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
289 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
398 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  31.44 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  31.44 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  35.2 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  44.21 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  31.44 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  31.44 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  35.48 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 
672 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.85 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  31.44 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  46.43 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.83 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.06 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  34.04 
 
 
785 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
689 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.85 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2447  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.27 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
1038 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
1301 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
704 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  30.93 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  40.43 
 
 
102 aa  72  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  44.57 
 
 
312 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  33.58 
 
 
338 aa  71.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
351 aa  71.6  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  36.65 
 
 
332 aa  71.6  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
326 aa  72  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1841  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.31 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  30.65 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.86 
 
 
957 aa  70.1  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  34.29 
 
 
1168 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
1001 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  41.51 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  35.97 
 
 
573 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>