72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0782 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  100 
 
 
85 aa  169  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  42.68 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  37.21 
 
 
87 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.61 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  35.37 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  34.52 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  34.12 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  38.1 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  33.73 
 
 
85 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.38 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  30.12 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.24 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  34.12 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.18 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4070  plasmid stabilization system protein  44.05 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0269  hypothetical protein  35.23 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.56 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.25 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  32.18 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.16 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  39.24 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.48 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  35.53 
 
 
712 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  36.14 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  36 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1045  hypothetical protein  30.59 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.114161  normal  0.183466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  35.29 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.94 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.63 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  32.56 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1787  hypothetical protein  30.43 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0433  hypothetical protein  30.59 
 
 
89 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.615805  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  31.46 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  30.34 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0404  hypothetical protein  32.58 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.111449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  27.06 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1786  hypothetical protein  32.18 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.697447  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1032  plasmid stabilization system  31.33 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.45088e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3073  plasmid stabilization system protein  43.28 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2431  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0603  plasmid stabilization system  37.5 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.837316  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2414  plasmid stabilization system protein  34.62 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.496322  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  34.44 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  27.71 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.23 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  33.33 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  36.67 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  31.11 
 
 
88 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2569  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  31.75 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  32.05 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.58 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  30.34 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  27.59 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2944  hypothetical protein  40.58 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3171  hypothetical protein  40.58 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00924455  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0124  hypothetical protein  32.18 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  29.35 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  30.49 
 
 
83 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0262  hypothetical protein  39.68 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0969188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0406  plasmid stabilization system  41.27 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  29.41 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.94 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1039  plasmid stabilization system  35.9 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  30.34 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  30.34 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1955  hypothetical protein  29.07 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000490141  n/a   
 
 
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  32.14 
 
 
93 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>