246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5269 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  681    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4549  hypothetical protein  76.35 
 
 
373 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  64.93 
 
 
356 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  62.43 
 
 
362 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  65.6 
 
 
346 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  63.66 
 
 
336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  67.7 
 
 
348 aa  342  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  63.38 
 
 
312 aa  335  7.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  57.85 
 
 
356 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  59.81 
 
 
350 aa  315  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  59.75 
 
 
360 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  49 
 
 
339 aa  278  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  55.31 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1346  hypothetical protein  47.65 
 
 
346 aa  266  5.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0950  hypothetical protein  55.69 
 
 
353 aa  255  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  51.29 
 
 
304 aa  235  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  34.08 
 
 
340 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  33.23 
 
 
340 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  32.48 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  32.8 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  32.48 
 
 
340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  32.48 
 
 
340 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  32.15 
 
 
352 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  32.15 
 
 
340 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  33.12 
 
 
352 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  33.12 
 
 
340 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  34.26 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  35.36 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  35.11 
 
 
348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  33.43 
 
 
352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  31.83 
 
 
337 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  35.38 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  32.75 
 
 
360 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  32.75 
 
 
360 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  30.96 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  28.33 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  31.34 
 
 
355 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  33.55 
 
 
324 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  30.21 
 
 
331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  34.27 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  29.41 
 
 
335 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  29.21 
 
 
338 aa  126  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  35.57 
 
 
372 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  29.34 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  29.34 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  32.35 
 
 
335 aa  119  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  30.57 
 
 
335 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  28.61 
 
 
340 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  29.06 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  28.38 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  28.38 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  28.38 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  28.38 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  30.46 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  28.38 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  28.82 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  29.49 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  30.72 
 
 
411 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  28.88 
 
 
348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  32.7 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  26.61 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  29.47 
 
 
368 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  28.86 
 
 
362 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  28.86 
 
 
362 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  28.86 
 
 
362 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  26.51 
 
 
339 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.65 
 
 
349 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.65 
 
 
349 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.65 
 
 
349 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.65 
 
 
349 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.65 
 
 
349 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.65 
 
 
349 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.65 
 
 
349 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.65 
 
 
349 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.65 
 
 
349 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  27.07 
 
 
328 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  28.99 
 
 
360 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  33.77 
 
 
361 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  34.07 
 
 
343 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  31.98 
 
 
345 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  27.15 
 
 
325 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  29.41 
 
 
361 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  33.52 
 
 
351 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09940  predicted membrane protein  33.86 
 
 
441 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.903662  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  32.21 
 
 
360 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  27.81 
 
 
343 aa  101  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1009  hypothetical protein  34.56 
 
 
338 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1641  hypothetical protein  34.56 
 
 
338 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4276  hypothetical protein  34.56 
 
 
338 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.745778  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  32.21 
 
 
360 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  33.33 
 
 
326 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  32.29 
 
 
343 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  28.35 
 
 
329 aa  99.4  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  30.13 
 
 
322 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  26.15 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  28.43 
 
 
310 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  29.63 
 
 
472 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4010  hypothetical protein  31.56 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115969  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  28.95 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>