25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4952 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  50.85 
 
 
1174 aa  909    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  53.63 
 
 
1175 aa  906    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  52.8 
 
 
1179 aa  900    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  50 
 
 
1210 aa  881    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  100 
 
 
1146 aa  2137    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  53.54 
 
 
1175 aa  905    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  28.6 
 
 
1186 aa  179  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  25.48 
 
 
1246 aa  161  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  26.21 
 
 
1273 aa  152  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  24.43 
 
 
1230 aa  125  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  23.2 
 
 
1238 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  23.4 
 
 
1234 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  32.92 
 
 
1331 aa  105  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  25.81 
 
 
1275 aa  96.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  29 
 
 
1278 aa  89.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  23.67 
 
 
1247 aa  82.8  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  29.35 
 
 
1247 aa  81.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  31.58 
 
 
1258 aa  80.9  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  28.22 
 
 
1239 aa  65.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  31.8 
 
 
1308 aa  63.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  28.16 
 
 
1274 aa  61.6  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  27.19 
 
 
1273 aa  55.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  29.49 
 
 
809 aa  52.8  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  32.2 
 
 
999 aa  52  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  30.17 
 
 
632 aa  45.8  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>