37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3343 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  100 
 
 		 401 aa  787    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  34.47 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  33.22 
 
 		 429 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  33.22 
 
 		 429 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  32.43 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  27.04 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  27.67 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  28.52 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  30.94 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  29.51 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  30.56 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  26.68 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  30.87 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  27 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  29.71 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  26.89 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  24.54 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  26.74 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  25.49 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  29.14 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  26.54 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  26.17 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  23.24 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  30.56 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  23.4 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  22.69 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  26.1 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  28.02 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  24.57 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  27.88 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  23.1 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  28.68 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  26.09 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  27.34 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>