37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2766 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
458 aa  896    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  53.27 
 
 
474 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  53.94 
 
 
472 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  52.64 
 
 
472 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  46.94 
 
 
468 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  46.46 
 
 
463 aa  277  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  29.19 
 
 
281 aa  93.6  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  28.78 
 
 
545 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  29.01 
 
 
966 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  28.25 
 
 
535 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  27.34 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  27.54 
 
 
990 aa  83.6  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  28.18 
 
 
993 aa  83.2  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  27.83 
 
 
978 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  29.32 
 
 
481 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  28.65 
 
 
505 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  27.36 
 
 
911 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  25.96 
 
 
1079 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  29.18 
 
 
529 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  46.84 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  33 
 
 
470 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  37.04 
 
 
480 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  34.18 
 
 
1108 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  41.89 
 
 
276 aa  53.9  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  36.84 
 
 
467 aa  53.9  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  23.9 
 
 
277 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  31.46 
 
 
237 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2393  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.75 
 
 
573 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0818028  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  33.96 
 
 
378 aa  50.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  31.11 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 
328 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 
328 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  34.67 
 
 
440 aa  47  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  33.78 
 
 
242 aa  47  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.86 
 
 
2449 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3058  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.79 
 
 
578 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522161  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1090  hypothetical protein  30.77 
 
 
249 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>