More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2472 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
469 aa  918    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.42 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.612622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4067  histidine kinase  62.72 
 
 
491 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.933577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3773  ATPase domain-containing protein  61.93 
 
 
486 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0284842  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  56.71 
 
 
454 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.95 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  40.13 
 
 
467 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 
446 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
444 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
442 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
472 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
485 aa  219  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  43.38 
 
 
276 aa  217  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  44.01 
 
 
458 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  38.83 
 
 
425 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
493 aa  216  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  38.57 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  38.57 
 
 
425 aa  215  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
717 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40 
 
 
443 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
454 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
473 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
494 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  40.57 
 
 
499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  32.06 
 
 
435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
451 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5209  two component sensor kinase  40.31 
 
 
440 aa  196  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
451 aa  196  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  39.47 
 
 
443 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
443 aa  193  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
442 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  33.22 
 
 
469 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
488 aa  190  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
488 aa  190  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
469 aa  189  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
473 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  40.43 
 
 
432 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  32.64 
 
 
440 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
456 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  38.54 
 
 
483 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
349 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  40.07 
 
 
440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
428 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
440 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
440 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  39.39 
 
 
438 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
463 aa  182  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  31.76 
 
 
434 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
479 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
535 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.13 
 
 
396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  38.3 
 
 
468 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
488 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
439 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  36.56 
 
 
474 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
443 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2285  sensor histidine kinase  36.65 
 
 
480 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0585987  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  34.62 
 
 
359 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
437 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
454 aa  177  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
440 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  39.01 
 
 
270 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  39.13 
 
 
391 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
330 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  36.79 
 
 
458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
484 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  36.78 
 
 
473 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
439 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  32.59 
 
 
439 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
476 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  36.78 
 
 
482 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
484 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
435 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
484 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
444 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
484 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
479 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
475 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
440 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
440 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  36.71 
 
 
442 aa  167  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  36.52 
 
 
448 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  40.08 
 
 
444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  36.81 
 
 
430 aa  163  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  35.09 
 
 
436 aa  163  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
442 aa  162  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  34.15 
 
 
344 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>