34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1040 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  44.97 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4924  hypothetical protein  48.6 
 
 		 409 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0637585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4460  hypothetical protein  47.98 
 
 		 409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4974  hypothetical protein  45 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  45.11 
 
 		 352 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  30 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  28.7 
 
 		 398 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  26.16 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  28.37 
 
 		 417 aa  86.3  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  31.48 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  31.11 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  27.98 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  31.85 
 
 		 394 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  32.75 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  25 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  26.35 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  32.76 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  26.35 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  33.76 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  29.7 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  24.19 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  29.17 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  26.28 
 
 		 470 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5820  hypothetical protein  27.47 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6227  hypothetical protein  29.46 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.039965  normal  0.0374412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  28.47 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  27.23 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  32.13 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  25.89 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  25.48 
 
 		 455 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  27.3 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  24.36 
 
 		 436 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  24.84 
 
 		 458 aa  43.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>