40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4078 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 231 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  67.83 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  68.26 
 
 		 252 aa  288  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  68.26 
 
 		 252 aa  288  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  65.8 
 
 		 250 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  67.26 
 
 		 264 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  40 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  37.56 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  36.97 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  37.5 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  37.21 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  32.22 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  29.78 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  37.13 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  37.88 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  36.63 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  36.63 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  38.37 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  37.86 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  33.78 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  36.71 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  36.71 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  37.68 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  33.33 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  36.05 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  34.21 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  33.99 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  31.05 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  33 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  31.96 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  33.51 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  33 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  24.44 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  28.43 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  25.74 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  24.89 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  23.98 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  34.51 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  29.23 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  27.75 
 
 		 224 aa  42  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>