More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3540 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
431 aa  850    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6753  glycosyl transferase group 1  59.76 
 
 
414 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3130  glycosyl transferase group 1  46.12 
 
 
448 aa  349  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3402  glycosyl transferase group 1  45.09 
 
 
448 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2590  glycosyl transferase, group 1  43.42 
 
 
410 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  37.4 
 
 
422 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 
422 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 
424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
423 aa  161  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
423 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
434 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  33.41 
 
 
421 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
420 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
434 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 
421 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
404 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
394 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
403 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  27.51 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
376 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
391 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
404 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  23.5 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
414 aa  86.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 
347 aa  82  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
810 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.28 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  33.33 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.54 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  33.71 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.57 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3683  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
402 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  30.83 
 
 
803 aa  67  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
379 aa  67  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1125  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
376 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
410 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 
355 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3532  glycosyl transferase group 1  37.88 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1672  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 
359 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6490  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632954  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
435 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0521  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.86 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  35.66 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
816 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 
409 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0807  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.66 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.64262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2684  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
328 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
385 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0643  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.66 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  27.89 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
424 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
364 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
435 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>