More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1309 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  95.83 
 
 		 527 aa  938    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  100 
 
 		 566 aa  1124    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  95.45 
 
 		 527 aa  950    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  63.58 
 
 		 506 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  35.36 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  34.33 
 
 		 526 aa  226  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  33.65 
 
 		 530 aa  223  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  30.99 
 
 		 491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  30.99 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  30.93 
 
 		 491 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  30.94 
 
 		 491 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  30.74 
 
 		 491 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  30.94 
 
 		 491 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  31 
 
 		 491 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  30.48 
 
 		 491 aa  207  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  35.31 
 
 		 540 aa  207  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  30.02 
 
 		 491 aa  207  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  30.67 
 
 		 491 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  35.84 
 
 		 499 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  33.66 
 
 		 481 aa  200  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  34.91 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  34.04 
 
 		 559 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  29.51 
 
 		 536 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  29.71 
 
 		 536 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  28.93 
 
 		 536 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  32.54 
 
 		 519 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  31.02 
 
 		 488 aa  183  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  29.04 
 
 		 536 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  28.74 
 
 		 536 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  30.77 
 
 		 540 aa  180  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  29.71 
 
 		 536 aa  180  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  28.65 
 
 		 533 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  28.46 
 
 		 536 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  28.46 
 
 		 536 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  32.39 
 
 		 536 aa  178  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  35.67 
 
 		 468 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  28.93 
 
 		 536 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.3 
 
 		 491 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  33.4 
 
 		 574 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.02 
 
 		 487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.05 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2352  amidase  35.71 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2061  amidase  35.71 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1369  amidase  35.71 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1087  amidase  35.71 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1454  amidase  35.71 
 
 		 528 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  33.08 
 
 		 475 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3236  amidase  35.71 
 
 		 528 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3121  amidase  35.71 
 
 		 528 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.99 
 
 		 475 aa  163  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3420  amidase  35.52 
 
 		 543 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  33.66 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.39 
 
 		 475 aa  160  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  29.33 
 
 		 544 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  31.69 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.04 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  32.68 
 
 		 463 aa  158  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2331  amidase  35.71 
 
 		 540 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.99 
 
 		 482 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1020  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.71 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00154188  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.52 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.46 
 
 		 479 aa  156  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.59 
 
 		 485 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  40.16 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.07 
 
 		 485 aa  153  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3426  amidase  28.27 
 
 		 520 aa  153  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000155871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3257  amidase  29.41 
 
 		 570 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2932  amidase  29.31 
 
 		 567 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.17 
 
 		 486 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2226  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.63 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0279752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3926  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.67 
 
 		 494 aa  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  35.63 
 
 		 497 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  31.72 
 
 		 463 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2760  amidase  29.14 
 
 		 567 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1657  amidase  29.69 
 
 		 567 aa  150  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.91372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.2 
 
 		 479 aa  150  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  33.13 
 
 		 533 aa  149  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  31.25 
 
 		 534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  33.47 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.5 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  28.9 
 
 		 477 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3079  amidase  29.59 
 
 		 567 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1714  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.49 
 
 		 504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  30.22 
 
 		 467 aa  147  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.54 
 
 		 501 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  30.36 
 
 		 510 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.95 
 
 		 486 aa  147  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2730  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.95 
 
 		 485 aa  147  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0351101  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  32.85 
 
 		 484 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2341  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.67 
 
 		 485 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  29.75 
 
 		 470 aa  146  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  32.75 
 
 		 473 aa  146  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  40.51 
 
 		 489 aa  146  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  41.32 
 
 		 505 aa  146  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2761  amidase  28.35 
 
 		 584 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.25 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.3 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  30.43 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0682  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  28.63 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.78 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>