34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0245 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  33.33 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.13 
 
 		 743 aa  99.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  28.57 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  32 
 
 		 226 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  30.35 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 		 730 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  28.14 
 
 		 216 aa  93.6  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  27.84 
 
 		 221 aa  93.2  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  28.37 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  29.82 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  28.65 
 
 		 223 aa  92  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  27.62 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  29.38 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  27.62 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  27.75 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  28.87 
 
 		 224 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  26.32 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  27.6 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  27.37 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  27.37 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  28.65 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  29.14 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  28.44 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  28.34 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  31.3 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.84 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1049  hypothetical protein  30.67 
 
 		 155 aa  52.4  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.341067  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0926  TenA/THI-4 protein  30.08 
 
 		 130 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.154815  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  24.58 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  30.39 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7726  hypothetical protein  25.43 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0956315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.04 
 
 		 623 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  24.71 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.749504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>