More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2352 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  48.85 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  48.3 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  46.56 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  46.83 
 
 		 141 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 147 aa  115  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  48.41 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  43.65 
 
 		 133 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  44.53 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.83 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.83 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.83 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.83 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.83 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  51.61 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  44.27 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 182 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  38.85 
 
 		 169 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  42.34 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  44.09 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  39.16 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  43.85 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  43.85 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  41.03 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  40.77 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  44.2 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  43.07 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  46.46 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40.38 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  41.04 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  41.27 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 129 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1095  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  43.59 
 
 		 186 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  42.52 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.54 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>