More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1745 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1745  putative membrane transport protein  100 
 
 		 446 aa  865    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4045  General substrate transporter  75.68 
 
 		 446 aa  651    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.849183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4056  major facilitator transporter  67.82 
 
 		 445 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713294  normal  0.178952 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5607  major facilitator protein family permease  66.37 
 
 		 439 aa  581  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1549  General substrate transporter  66.59 
 
 		 439 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.28146 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4889  general substrate transporter  69.28 
 
 		 438 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.321376  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2224  major facilitator superfamily transporter  65.75 
 
 		 444 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.199134  hitchhiker  0.000423669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1878  major facilitator superfamily MFS_1  66.82 
 
 		 439 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.232309 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5984  General substrate transporter  63.09 
 
 		 443 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4373  general substrate transporter  65.74 
 
 		 446 aa  544  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7134  General substrate transporter  64.45 
 
 		 443 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4779  General substrate transporter  64.06 
 
 		 444 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0207001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2774  general substrate transporter  67.26 
 
 		 443 aa  511  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.835468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5736  general substrate transporter  60.63 
 
 		 447 aa  511  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2264  General substrate transporter  67.49 
 
 		 443 aa  511  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1730  general substrate transporter  59.86 
 
 		 443 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366529  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0243  MFS permease  61.65 
 
 		 435 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4855  General substrate transporter  60.96 
 
 		 454 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2029  major facilitator superfamily permease  61.29 
 
 		 436 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1509  general substrate transporter  61.86 
 
 		 442 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.386131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4338  putative transmembrane transporter protein  60.96 
 
 		 472 aa  488  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4707  putative transmembrane transporter protein  60.96 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.544234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0594  general substrate transporter  61.86 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5109  major facilitator transporter  54.59 
 
 		 441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2283  putative transport protein  43.06 
 
 		 418 aa  316  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  40 
 
 		 437 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.86 
 
 		 436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  38.28 
 
 		 431 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  37.7 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 425 aa  252  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  39.12 
 
 		 434 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  38.93 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  36.77 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  36.77 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  36.77 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 452 aa  229  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 628 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.88 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.14 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.35 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  37.41 
 
 		 437 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  38.4 
 
 		 412 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  33.33 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  38.12 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  34.5 
 
 		 483 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  32.55 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  32.76 
 
 		 470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.67 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.73 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  36.21 
 
 		 435 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.19 
 
 		 441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  35.51 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  34.6 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.73 
 
 		 442 aa  212  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.26 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  37.06 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  33.11 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  33.19 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 436 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  35.19 
 
 		 472 aa  210  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  36.43 
 
 		 489 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.43 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  36.43 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  36.16 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  36.19 
 
 		 523 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  37.38 
 
 		 506 aa  207  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 839 aa  206  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  36.19 
 
 		 437 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  36.19 
 
 		 437 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  36.19 
 
 		 437 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 442 aa  203  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.34 
 
 		 435 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.41 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.41 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  35 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.27 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  33.56 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  33.33 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  33.33 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  33.33 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  33.33 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  34.07 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.94 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  34.71 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  35.34 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.71 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  34.71 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.71 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.71 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.71 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  36.1 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  33.66 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>