213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0917 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  38.17 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  34.48 
 
 
244 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2711  protein of unknown function DUF81  35.78 
 
 
249 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2277  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
259 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5416  protein of unknown function DUF81  34.6 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  28.88 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.98 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  28.12 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  28.12 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.12 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  28.12 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  28.12 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  28.12 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  28.12 
 
 
266 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  31.91 
 
 
291 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  27.68 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.76 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  27.68 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  29.7 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  32.4 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  30 
 
 
282 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  25.69 
 
 
263 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  27.16 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  31.66 
 
 
309 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  29.54 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.38 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  40.62 
 
 
296 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  40.62 
 
 
305 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  26.22 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  25.79 
 
 
265 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  26.07 
 
 
254 aa  55.1  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  28.98 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  33.7 
 
 
350 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  26.19 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  23.68 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  24.71 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  31.84 
 
 
299 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  27.11 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  30.39 
 
 
345 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  27.52 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  26.42 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  30.7 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  27.78 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  29.65 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  29.15 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  32.97 
 
 
346 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  22.22 
 
 
223 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  29.15 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  24.66 
 
 
265 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  25.4 
 
 
260 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  27.15 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  29.02 
 
 
267 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  25.4 
 
 
260 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  22.46 
 
 
275 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  22.46 
 
 
275 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  24.66 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  25.51 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  31.93 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  25.09 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  26.69 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  30.1 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  27.46 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  37.07 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  27.46 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  33.67 
 
 
346 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  29.41 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  24.52 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  35.11 
 
 
308 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  26.69 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  24.77 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  25.97 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  26.72 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  26.69 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  36.47 
 
 
307 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4460  hypothetical protein  26.54 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  24.11 
 
 
268 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  31.06 
 
 
300 aa  49.3  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  29.46 
 
 
277 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  36.47 
 
 
307 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  27.67 
 
 
268 aa  48.9  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  29.78 
 
 
259 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  29.78 
 
 
259 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  27.11 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  29.18 
 
 
305 aa  48.5  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  27.22 
 
 
273 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3781  permease  23.35 
 
 
251 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  24.12 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  30.67 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  26.54 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  36.46 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  22.27 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  21 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1533  permease  23.35 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311144 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  25.73 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  27.91 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>