More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0774 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0774  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  333  5e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00906515  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3962  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.48 
 
 
158 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.08 
 
 
174 aa  226  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1094  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.45 
 
 
166 aa  213  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.23 
 
 
180 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.824071 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0842  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  61.54 
 
 
178 aa  201  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.76 
 
 
170 aa  201  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.775972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4186  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.78 
 
 
180 aa  190  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1491  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  55.7 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0201643  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2431  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.63 
 
 
194 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1094  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  69.75 
 
 
119 aa  167  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.01 
 
 
160 aa  155  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.32 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.41 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.34 
 
 
158 aa  137  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  49.67 
 
 
169 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.37 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0971976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.33 
 
 
240 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.33 
 
 
158 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.67 
 
 
157 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.06 
 
 
169 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.56 
 
 
171 aa  94  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.71 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1995  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.76 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.25 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1723  hypothetical protein  39.47 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4125  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.47 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.63 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1211  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  34.44 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.53 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  38.82 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.84 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.53 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.18 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  31.76 
 
 
564 aa  67  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.52 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.34 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.96 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4568  cytosine/adenosine deaminase  38.84 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0674269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2031  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.45 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.64 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2050  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.03 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.385935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3453  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.43 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  37.89 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  32.54 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2012  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.53 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.51 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  37.27 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.19 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.57 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325867  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  43.37 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.82 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35 
 
 
146 aa  61.6  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
155 aa  61.6  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  41 
 
 
158 aa  60.8  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  41 
 
 
167 aa  60.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.23 
 
 
176 aa  60.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.43 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.33 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3346  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.29 
 
 
143 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.18 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5394  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.29 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0109  cytosine/adenosine deaminase  41.05 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.16 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.73 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.39 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  35.14 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0231  hypothetical protein  29.92 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  28.23 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.78 
 
 
144 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.22 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.23 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  40.82 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.57 
 
 
475 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5985  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755307  normal  0.455465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.4 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  32.35 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.82 
 
 
154 aa  58.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.21 
 
 
156 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  34.74 
 
 
154 aa  58.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  30.4 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  35.14 
 
 
204 aa  58.2  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  32.71 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  39.18 
 
 
182 aa  57.8  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.58 
 
 
168 aa  57.8  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  40 
 
 
222 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  36.27 
 
 
193 aa  57.4  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04619  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  32.21 
 
 
186 aa  57.4  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2323  tRNA-adenosine deaminase  38.55 
 
 
150 aa  57.4  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.034799 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03330  tRNA-adenosine deaminase  48.84 
 
 
168 aa  57.4  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  38.53 
 
 
137 aa  57.4  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00510  cytosine/adenosine deaminase  32.19 
 
 
163 aa  57.4  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.21 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.96 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.96 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  51.72 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  36.27 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.34 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>