More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2546 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  100 
 
 		 370 aa  743    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  76.01 
 
 		 371 aa  571  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  72.09 
 
 		 370 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  66.94 
 
 		 371 aa  530  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  66.58 
 
 		 370 aa  518  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  55.56 
 
 		 364 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  53.95 
 
 		 363 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  49.73 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  51.75 
 
 		 369 aa  371  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  50 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  50.95 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  50.41 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  46.7 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  47.14 
 
 		 369 aa  338  9e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  44.85 
 
 		 370 aa  306  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  43.94 
 
 		 367 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  45.79 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  45.5 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  44.07 
 
 		 369 aa  293  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  42.22 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  43.67 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  42.78 
 
 		 368 aa  285  5.999999999999999e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  44.92 
 
 		 370 aa  282  6.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  41.87 
 
 		 368 aa  281  9e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  43.75 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  41.87 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  43.01 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  41.4 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  46.48 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  39.94 
 
 		 346 aa  261  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  30.62 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  29.63 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  28.23 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  31.42 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  29.95 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  27.35 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  28.27 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  26.9 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  27.49 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  27.06 
 
 		 387 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  27.9 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  27.35 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  34.93 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  34.01 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  44.83 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  44.83 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  31.78 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  43.37 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  32.82 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.13 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  41.38 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.38 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  41.38 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  27.98 
 
 		 513 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.38 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  28.31 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  44.19 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  39.08 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  39.09 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  38.64 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  43.68 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  25 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.74 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  39.09 
 
 		 435 aa  67  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.18 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.5 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  38.46 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  25.86 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.32 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.63 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  40.91 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  24.91 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  39.08 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.93 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  39.08 
 
 		 563 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  40.23 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  39.56 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  35.94 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  27.6 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  41.3 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0699  GTPase ObgE  34.17 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.244108  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  40.7 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.4 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  28.7 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  40.43 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  33.58 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.91 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  44.55 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  37.14 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  39.36 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  41.57 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.96 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  39.36 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  39.36 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.85 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  38.3 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  39.77 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  39.77 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  37.21 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.78 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>