64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1131 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1131  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 401 aa  790    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.209154  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3537  major facilitator transporter  22.14 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2601  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602564  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3982  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22510  MFS transporter  30.56 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  27.25 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  25.2 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  25.55 
 
 		 412 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  25.55 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  25.55 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  22.99 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  24.44 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.7 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.72 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  24.84 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  24.57 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 517 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  25.62 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  24.29 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  25.14 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  25.14 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  22.34 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  25.43 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  24.52 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  24.29 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  25.43 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  25.43 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.12 
 
 		 399 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  22.75 
 
 		 394 aa  46.6  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  30.63 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.54 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  24.38 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  22.01 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.1 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.57 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.57 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  28.07 
 
 		 519 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.72 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  32 
 
 		 487 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 497 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  23.85 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>