10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3982 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3537  major facilitator transporter  97.53 
 
 		 405 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3982  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  779    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2601  major facilitator transporter  84.45 
 
 		 373 aa  597  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602564  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1131  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.209154  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22510  MFS transporter  31.95 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0970  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 459 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16580  major facilitator superfamily protein  28.75 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  34.17 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  36.62 
 
 		 391 aa  43.1  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>